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J-GLOBAL ID：201902267536862338   整理番号：19A1132701

コリアンダのトランスクリプトームプロファイリング: 二重目的作物は幹のゴール抵抗性遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome profiling of coriander: a dual purpose crop unravels stem gall resistance genes

著者 (7件)： Choudhary Sharda (ICAR-National Research Centre on Seed Spices, Tabiji, Ajmer, India) ,  Naika Mahantesha B. N. (Department of Biotechnology and Crop Improvement, K. R. C. College of Horticulture, University of Horticultural Sciences, Bagalkot, Arabhavi, India) ,  Sharma Radheshyam (ICAR-National Research Centre on Seed Spices, Tabiji, Ajmer, India) ,  Sharma Radheshyam (Biotechnology Centre, Jawaharlal Nehru Krishi Vishva Vidhyalya, Jabalpur, India) ,  Meena R. D. (ICAR-National Research Centre on Seed Spices, Tabiji, Ajmer, India) ,  Singh Ravindra (ICAR-National Research Centre on Seed Spices, Tabiji, Ajmer, India) ,  Lal Gopal (ICAR-National Research Centre on Seed Spices, Tabiji, Ajmer, India)
資料名： Journal of Genetics  (Journal of Genetics)
巻： 98  号： 1  ページ： 1-11  発行年： 2019年 
JST資料番号： W0537A  ISSN： 0022-1333  CODEN： JOGNAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 茎ゴール(Protomyces macroposporus Unger)は,収量における重い損失を引き起こすコリアンダー(Coriandrum sativum L.)の葉,葉柄,茎および果実に影響を及ぼす重大な病気である。茎虫病に対するコリアンダーの遺伝的改善が不可欠である。茎ゴール抵抗性(ACR-1)と感受性(Cs-6)葉試料のコリアンダー品種を利用し,Illina NextSeq500プラットフォームを用いてトランスクリプトームを配列決定した。低品質の読み取りとアダプタ配列をトリミングした後に,全部で49,163,108と43,746,120の高品質の読み取りが保持され,更なる組立が59,933と56,861の検証された転写産物をもたらした。著者らは,NCBI nrデータベースを用いて,50506および46,945が注釈付けられた52,506および48,858のコード配列(CDS)を予測した。遺伝子オントロジー分析は,19,099および17,625の用語を注釈した。経路分析は,24の異なる機能的経路カテゴリーを得た;シグナル伝達,輸送,異化,翻訳および炭水化物代謝経路などが支配的であった。差次的に発現された遺伝子解析は,431と400の遺伝子がそれぞれ有意に上方制御され,下方制御された13123のCDSを予測した。それにおいて,ERF,NAC,bZIP,MYB,DREBおよびWRKYと抗真菌関連遺伝子のようなストレス誘導性転写因子を予測した。耐性におけるHSP20遺伝子発現のリアルタイムPCR分析は,感受性試料に対する10倍のアップレギュレーションを示し,18sは正規化のためのハウスキーピング遺伝子として使用された。本結果は,コリアンダーにおける幹ゴールへの抵抗性の発達の基礎となる様々な側面への洞察を提供する。Copyright 2019 Indian Academy of Sciences Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  転写因子 ,  *農作物 ,  品種 ,  感受性 ,  アノテーション ,  データベース ,  遺伝子発現 ,  *トランスクリプトーム ,  真菌類 ,  品質 ,  正規化 ,  *遺伝
準シソーラス用語： 遺伝子解析 ,  Coriandrum sativum , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： コリアンダ ,  幹のゴール ,  トランスクリプトーム ,  注釈 ,  耐性遺伝子

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 作物 ,  幹 ,  ゴール ,  抵抗性遺伝子