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J-GLOBAL ID：201902268532517208   整理番号：19A0488109

マイクロサテライト(SSR)マーカーによるケニアのBrachiaria grass生態型の分子特性化【JST・京大機械翻訳】

Molecular Characterizations of Kenyan Brachiaria Grass Ecotypes with Microsatellite (SSR) Markers

著者 (7件)： Ondabu Naftali (Biosciences Eastern and Central Africa-International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi 00100, Kenya) ,  Ondabu Naftali (Kenya Agricultural and Livestock Research Organization (KALRO), P.O. Box 57811, Nairobi 00200, Kenya) ,  Maina Solomon (Biosciences Eastern and Central Africa-International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi 00100, Kenya) ,  Kimani Wilson (Biosciences Eastern and Central Africa-International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi 00100, Kenya) ,  Njarui Donald (Kenya Agricultural and Livestock Research Organization (KALRO), P.O. Box 57811, Nairobi 00200, Kenya) ,  Djikeng Appolinaire (Biosciences Eastern and Central Africa-International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi 00100, Kenya) ,  Ghimire Sita (Biosciences Eastern and Central Africa-International Livestock Research Institute (BecA-ILRI) Hub, P.O. Box 30709, Nairobi 00100, Kenya)
資料名： Agronomy (Web)  (Agronomy (Web))
巻： 7  号： 1  ページ： 8  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7129A  ISSN： 2073-4395  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Brachiaria grassは,ケニアにおける家畜生産のための新たな飼料オプションである。ケニアはBrachiaria種に対する多様性の中心内にあり,したがって,Brachiariaの自然個体群における高い遺伝的変異が期待される。作物生産と非農業利用と気候変動のための自然植生の過剰放牧と除去は,自然生物多様性を脅かし続けている。本研究では,ケニアの異なる部分から79のBrachiaria生態型を収集し,それらを遺伝的変異とそれらの8つの商業的品種との関連性について調べた。全部で120の異なる対立遺伝子が,79の生態型で22のマーカーによって検出された。マーカーは,それぞれ0.623および0.583の平均多様性および多型情報含有量を有する生態型の識別において非常に有益であった。5つの亜母集団:国際家畜研究所(ILRI),Kitui,KiSII,Alupe,およびKimininiは,サンプルサイズ,対立遺伝子の数,私的対立遺伝子の数,多様性指数,およびパーセント多形性遺伝子座において異なった。Kenyan生態型個体群の全遺伝的変異に対する個体内差の寄与は81%であり,固定指数(FST=0.021)と世代当たりの移住数(Nm=11.58)は個体群間で低い遺伝的分化を示した。遺伝的距離は,AlupeとKiSII個体群(0.510)の間で最も高く,ILRIとKimini個体群(0.307)の間で最も低かった。非加重近隣結合(NJ)ツリーは,3つの主要クラスタに分類された試験生態型を示した:ILRI生態型はすべてのクラスタに存在した;KiSIIとAllupe生態型と改良品種はクラスタIとIIに分類された;そして,KituiとKiminiからの生態型はクラスタIに分類された。本研究は,3つの種を代表する8つの商業的品種(Basilisk,Humidicola,Llanero,marandu,MG4,Mulato II,piataおよびXaraes)よりもKenyan生態型におけるより高い遺伝的多様性を確認した。地方生態型の更なる収集とそれらの形態学的,農業学的および遺伝的特性化の必要性があり,Brachiaria grassの育種と保存プログラムを支持する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生物多様性 ,  *マイクロサテライト ,  クラスタ ,  対立遺伝子 ,  農業 ,  放牧 ,  育種 ,  気候変動 ,  個体群 ,  品種 ,  家畜 ,  *ケニア共和国
準シソーラス用語： 遺伝的変異 ,  *生態型 ,  *ニクキビ属 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 分子分散の解析 ,  育種 ,  固定指数 ,  遺伝的保存 ,  民間対立遺伝子

分類 (1件)： 飼料作物,草地  (FC03050J)

引用文献 (42件)：

• Renvoize, S.A.; Clayton, W.D.; Kabuye, C.H.S. Morphology, taxonomy and natural distribution of Brachiaria (Trin.) Griseb. In Brachiaria: Biology, Agronomy, and Improvement; Miles, J.W., Maass, B.L., do Valle, C.B., Eds.; International Centre for Tropical Agriculture: Cali, Colombia, 1996; pp. 1-15.
• Miles, J.W.; Maass, B.L.; do Valle, C.B. Brachiaria: Biology, Agronomy, and Improvement; International Centre for Tropical Agriculture: Cali, Colombia, 1996; p. 288.
• Holmann, F.; Rivas, L.; Argel, P.J.; Perez, E. Impact of the adoption of Brachiaria grasses: Central America and Mexico. Livest. Res. Rural Dev. 2004, 16. Available online: http://www.lrrd.org/lrrd16/12/holm16098.htm (accessed on 21 January 2017).
• Jotee, D. Evaluation of the potential of some common forage germplasms in Mauritius. In Proceedings of the Third PANESA Workshop, Arusha, Tanzania, 27-30 April 1987; Dzowela, B.H., Ed.; ILCA: Addis Ababa, Ethiopia, 1988; pp. 81-90.
• Subbarao, G.V.; Nakahara, K.; Hurtado, M.P.; Ono, H.; Moreta, D.E.; Salcedo, A.F.; Yoshihashi, A.T.; Ishikawa, T.; Ishitani, M.; Ohnishi-Kameyama, M.; et al. Evidence for biological nitrification inhibition in Brachiaria pastures. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 17302-17307.

タイトルに関連する用語 (7件)： マイクロサテライト ,  SSR ,  マーカー ,  ケニア ,  Brachiaria ,  生態型 ,  分子特性