超表面多孔性逆相液体クロマトグラフィー及びFourier変換質量分析によるミエリン塩基性蛋白質の連続溶出プロテオフォーム同定【JST・京大機械翻訳】

Plymire Daniel A.; Wing Casey E.; Robinson Dana E.; Patrie Steven M.; Patrie Steven M.

文献

J-GLOBAL ID：201902269437637222 整理番号：19A1804929

超表面多孔性逆相液体クロマトグラフィー及びFourier変換質量分析によるミエリン塩基性蛋白質の連続溶出プロテオフォーム同定【JST・京大機械翻訳】

Continuous Elution Proteoform Identification of Myelin Basic Protein by Superficially Porous Reversed-Phase Liquid Chromatography and Fourier Transform Mass Spectrometry

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資料名：
巻： 89 号： 22 ページ： 12030-12038 発行年： 2017年
JST資料番号： A0395A ISSN： 0003-2700 CODEN： ANCHAM 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ミエリン塩基性蛋白質(MBP)は神経ミエリン鞘において重要な構造的及び機能的役割を果たす。翻訳されたMBPは,多数のオルタナティブスプライス変異体(ASV)を有する極端な微小不均一性を示し,翻訳後修飾(PTMs)は,中枢神経系成熟,ミエリン安定性,および種々の脱および染色体障害の病理生物学に対して報告されている。従来のバイオ分析ツールは,ASVおよびPTMイベントを同時に効率的に調べることができず,ヒトの生理学および疾患におけるMBPの微小不均一性の役割の理解を制限する。この必要性を扱うために,超表面多孔性逆相液体クロマトグラフィー(SPLC),Fourier変換質量分析(FTMS),ノズル-スキマー解離(NSD)によるデータ非依存取得(DIA),及びマウス組織内の豊富なMBPプロテオフォームを迅速に特性化するためのデータ処理資源を組み合わせたトップダウンプロテオミクスパイプラインを報告した。3層プロテオフォーム同定と特性化ワークフローは,4つの既知のMBP ASVsと,約0.5μgの材料上での単一90分のSPLC-FTMSからの数百の差別的に修飾された状態を解決した。これは14.1kDa ASVのみに対して323のプロテオフォームを含んだ。また,17.125kDa ASVのC78でパルミチン酸,オレイン酸,ステアリン酸を結びつけるS-アシル化事象を特性化する前に,MBP遺伝子の代替転写開始部位(ATSS)から2つの新規ASVを同定した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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蛋白質・ペプチド一般 , 各種分析法一般 , 質量分析

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