文献

J-GLOBAL ID：201902270115240186   整理番号：19A0886924

予測蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークにより明らかにされたUstilaginoideaウイルスにおける病原性遺伝子【JST・京大機械翻訳】

Pathogenicity Genes in Ustilaginoidea virens Revealed by a Predicted Protein-Protein Interaction Network

著者 (7件)： Zhang Kang (Department of Plant Pathology and the Ministry of Agriculture Key Laboratory for Plant Pathology, China Agricultural University, China) ,  Li Yuejiao (Department of Plant Pathology and the Ministry of Agriculture Key Laboratory for Plant Pathology, China Agricultural University, China) ,  Li Tengjiao (Department of Plant Pathology and the Ministry of Agriculture Key Laboratory for Plant Pathology, China Agricultural University, China) ,  Li Zhi-Gang (Department of Plant Pathology and the Ministry of Agriculture Key Laboratory for Plant Pathology, China Agricultural University, China) ,  Hsiang Tom (School of Environmental Sciences, University of Guelph, Ontario, Canada) ,  Zhang Ziding (State Key Laboratory of Agrobiotechnology, College of Biological Sciences, China Agricultural University, China) ,  Sun Wenxian (Department of Plant Pathology and the Ministry of Agriculture Key Laboratory for Plant Pathology, China Agricultural University, China)
資料名： Journal of Proteome Research  (Journal of Proteome Research)
巻： 16  号： 3  ページ： 1193-1206  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1632A  ISSN： 1535-3893  CODEN： JPROBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Ustilaginoideavirensによって引き起こされたイネの偽のsmは,イネの収量と穀粒品質において有意な損失を生み出し,世界中で最も重要なイネ病の1つとして最近出現した。イネ生産におけるその重要性にもかかわらず,複雑な相互作用と病原性遺伝子相互作用を説明するための研究は比較的少ない。ここでは,U.virensの蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークを,2つの良く認識されたアプローチ,すなわち,領域およびドメイン間相互作用に基づく方法により構築した。3305の蛋白質に関連する合計20217の相互作用が,厳密なフィルタリング後に予測された。ネットワークの信頼性を計算的および実験的に評価した。相互作用ネットワークのトポロジーは高度に連結した蛋白質を明らかにした。初期U.virens感染の間にアップレギュレートされた遺伝子を含む病原性関連サブネットワークも構築され,多くの新規病原性蛋白質がサブネットワークにおいて予測された。加えて,著者らは,U.virensとOryza sativaの間に種間PPIネットワークを構築し,この宿主病原体病原系の分子相互作用に対する新しい洞察を提供した。これらの相互作用ネットワークに基づくWebに基づく公開可能な対話型データベースも公開されている。要約すると,PPIネットワークの蛋白質スケールマップは,U.virensについて記述され,その病原性に関連する遺伝子の相互作用を細かく分析するための新しい展望を提供するであろう。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： Web【情報システム】 ,  フィルタリング ,  *ネットワーク ,  分子間相互作用 ,  *相互作用 ,  位相幾何学 ,  *予測 ,  *遺伝子 ,  *タンパク質 ,  病原体 ,  データベース ,  *病原性
準シソーラス用語： サブネットワーク ,  *Ustilaginoidea ,  *蛋白質間相互作用 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Ustilaginoidea virens ,  蛋白質-蛋白質相互作用(PPI) ,  Interolog ,  ドメイン-ドメイン相互作用 ,  病原性 ,  分泌蛋白質

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 予測 ,  蛋白質-蛋白質相互作用 ,  ウイルス ,  病原性遺伝子