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J-GLOBAL ID：201902270475535919   整理番号：19A2827659

Sorangium cellulosumにおけるTall-TFおよびCRISPR/DCAS9系により媒介されるエポチロン生産の容易で効率的な戦略【JST・京大機械翻訳】

An Easy and Efficient Strategy for the Enhancement of Epothilone Production Mediated by TALE-TF and CRISPR/dcas9 Systems in Sorangium cellulosum

著者 (9件)： Ye Wei (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Liu Taomei (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Zhu Muzi (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Zhang Weimin (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Huang Zilei (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Li Saini (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Li Haohua (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Kong Yali (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Chen Yuchan (State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China)
資料名： Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (Web)  (Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (Web))
巻： 7  ページ： 334  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7059A  ISSN： 2296-4185  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エポチロンは,癌細胞に対して強い細胞毒性を有し,タキソールと比較して比較的低い副作用を有する一種のマクロライドである。エポチロンB誘導体イキサベepilは,進行乳癌の臨床治療に使用されている。しかしながら,エポチロンの低収率とSorangiumセルロースの遺伝的操作の困難さは,それらのより広い応用を制限した。転写活性化因子(TALE-TF)-VP64およびクラスター化した規則的間隔の短いパリンdroリピート(CRISPR)/dCas9-VP64は,転写改善のための効果的なシステムとして示されている。本研究では,エポチロン生合成クラスターのプロモーターを得て,その機能を検証した。TALE-TF-VP64とCRISPR/dcas9-VP64標的P3プロモーターはS.cellulosum株So ce M4に電気穿孔され,エポチロン生合成関連遺伝子の転写レベルは有意に上方制御された。エポチロンBの収率は,組換え型TALE-TF-VP64-P3およびdCas9-VP64-P3要素のSo ce M4への導入により,それぞれ2.89および1.53倍改善された。エポチロンD収率は組換dCas9-So ce M4及びTALE-VP64株においてそれぞれ1.12及び2.18倍改善された。TALE-TF-VP64の転写調節機構と内因性転写因子による競合機構を電気泳動移動度シフト分析(EMSA)とクロマチン免疫沈降(ChIP)により研究し,P3プロモーターとTALE-TF要素の組合せとTALE-TFと内因性転写蛋白質間の競合を示した。これは,TALE-TFおよびdCas9-VP64系を用いたS.cellulosumのエポチロン生合成遺伝子クラスターの転写調節に関する最初の報告であり,S.cellulosumにおけるエポチロン生合成のためのTALE-TF系の調節機構も最初に明らかにされ,したがって,エポチロン収率を改善し,生物医学産業におけるエポチロンの応用を促進する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  エレクトロポレーション ,  遺伝 ,  副作用 ,  *生合成 ,  タンパク質 ,  転写因子 ,  クラスタ ,  セルロース ,  アップレギュレーション ,  クラスタ化 ,  細胞毒性 ,  プロモーター領域 ,  腫瘍細胞
準シソーラス用語： *Sorangium , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Sorangium cellulosum ,  物語-TF ,  CRISPR/DCA9活性化 ,  エポチロン ,  調節機構

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (30件)：

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• Ashworth J., Baker D. (2009). Assessment of the optimization of affinity and specificity at protein-DNA interfaces. Nucleic Acids Res. 37:e73. doi: 10.1093/nar/gkp242
• Bian X., Tang B., Yu Y., Tu Q., Gross F., Wang H., et al. (2017). Heterologous production and yields improvement of epothilones in Burkholderiales strain DSM 7029. ACS Chem. Biol. 12, 1805-1812. doi: 10.1021/acschembio.7b00097
• Bollag D. M., McQueney P. A., Zhu J., Hensens O., Koupal L., Liesch J., et al. (1995). Epothilones, a new class of microtubule-stabilizing agents with a taxol-like mechanism of action. Cancer Res. 55, 2325-2333. doi: 10.1021/acschembio.7b00097
• Chavez A., Scheiman J., Vora S., Pruitt B. W., Tuttle M. P. R., Iyer E., et al. (2015). Highly efficient Cas9-mediated transcriptional programming. Nat. Methods 12, 326-328. doi: 10.1038/nmeth.3312

タイトルに関連する用語 (3件)： CRISPR ,  容易 ,  戦略