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J-GLOBAL ID：201902271409467509   整理番号：19A0660214

9-アミノアクリジン半サンドイッチRu(II),Rh(III)及びIr(III)抗腫瘍錯体の構造及び光学特性のDFTシミュレーション及びそれらのDNAとの相互作用【JST・京大機械翻訳】

DFT Simulation of Structural and Optical Properties of 9-Aminoacridine Half-Sandwich Ru(II), Rh(III), and Ir(III) Antitumoral Complexes and Their Interaction with DNA

著者 (7件)： Ceron-Carrasco Jose Pedro (Bioinformatics and High Performance Computing Research Group (BIO-HPC), Universidad Catolica San Antonio de Murcia (UCAM), Spain) ,  Ruiz Jose (Departamento de Quimica Inorganica, Universidad de Murcia) ,  Vicente Consuelo (Departamento de Quimica Inorganica, Universidad de Murcia) ,  de Haro Concepcion (Departamento de Quimica Inorganica, Universidad de Murcia) ,  Bautista Delia (SAI, Universidad de Murcia) ,  Zuniga Jose (Departamento de Quimica Fisica, Universidad de Murcia) ,  Requena Alberto (Departamento de Quimica Fisica, Universidad de Murcia)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 8  ページ： 3898-3910  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,DFTに基づく方法を用いて,化学構造,光学特性,および最近合成されたキレート化C^N9-アミノアクリジンアレーンRu-(II)抗癌剤のDNAとの相互作用,およびDFTベースの方法を用いた2つの新しい密接に関連したRh-(III)およびIr-(III)錯体を用いた。4つの化学モデルと,PBE0,B97D,ωB97X-D,M06,およびM06-L密度汎関数,およびLANL2DZ,def2-SVP,およびdef2-TZVP基底関数を含む多くの理論的アプローチをテストした。最適化プロセスに対する最良の全体的精度/コスト性能は,理論のωB97X-D/def2-SVPおよびM06/def2-SVPレベルで達成された。明示的溶媒分子(CHCl_3)の包接は,幾何学をさらに精密化し,一方,結晶ネットワークを考慮すると,計算した結合距離と角度の有意な改善を与えなかった。励起状態の解析は,M06準位がωB97X-Dと比較して,実験吸収スペクトルより良く一致することを明らかにした。したがって,M06/def2-SVPアプローチの使用は,このタイプの抗腫瘍性複合体の生物活性を理論的に研究するための良くバランスした方法であり,DNAとの反応性を評価するために,このTD-DFTアプローチを分子動力学シミュレーションに結合した。報告された結果は,これらの薬物がDNAに電子を注入するために使用できることを示し,それは光活性化化学療法におけるそれらの応用とDNAベースの電気化学的ナノデバイスのための新しい材料として広がる可能性がある。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 精密化 ,  複合体 ,  密度汎関数法 ,  *相互作用 ,  *DNA【核酸】 ,  結晶 ,  抗腫瘍作用 ,  計算機シミュレーション ,  キレート化 ,  ネットワーク ,  最適化 ,  *錯体 ,  *腫瘍 ,  抗腫瘍薬
準シソーラス用語： ナノデバイス ,  TDDFT , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子の電子構造  (BH05010Q) ,  分子間相互作用  (BH07020P)

タイトルに関連する用語 (12件)： アミノアクリジン ,  サンドイッチ ,  Ru ,  Rh ,  Ir ,  腫瘍 ,  錯体 ,  光学特性 ,  DFT ,  シミュレーション ,  DNA ,  相互作用