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J-GLOBAL ID：201902272044626670   整理番号：19A0517353

酵母蛋白質相互作用ネットワークのための統合マルチソース生物学情報に基づく改良考古学アルゴリズム【JST・京大機械翻訳】

An Improved Archaeology Algorithm Based on Integrated Multi-Source Biological Information for Yeast Protein Interaction Network

著者 (4件)： Zhang Jin (Business School, University of Shanghai for Science and Technology, Shanghai, China) ,  Yang Huijie (Business School, University of Shanghai for Science and Technology, Shanghai, China) ,  Song Houbing (Department of Electrical and Computer Engineering, West Virginia University, Morgantown, WV, USA) ,  Zhang Yuan (Shandong Provincial Key Laboratory of Network Based Intelligent Computing, University of Jinan, Jinan, China)
資料名： IEEE Access  (IEEE Access)
巻： 5  ページ： 15893-15900  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2422A  ISSN： 2169-3536  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： タンデム親和性精製(TAP)及び酵母2ハイブリッド(Y2H)のような高スループット相互作用検出技術の開発により,利用可能なゲノム全体蛋白質-蛋白質相互作用(PPIs)データは近年増加している。数学的,物理的および人工知能法を用いて,計算生物学におけるいくつかの研究者は,現在のPPIネットワーク(PIN)に従って蛋白質の進化年齢を明らかにすることに焦点を合わせたが,それらの精度を改善することは困難であった。妥当な説明は,それらが非生物学的技術により生物学的問題を解決し,蛋白質の生物学的背景や意味,それらの関係に多くの注意を提供しないことである。本論文では,酵母PINに対する考古学アルゴリズムの各反復における年齢予測と巧みな「埋め込み」多源生物学的情報の精度を改善するための2つの方法を提案した。一方では,多重配列アラインメントと隣接結合アルゴリズムによって構築された460の遺伝子ツリーから得られる非重複蛋白質対を減少させることによって,誤差を逆転させる確率を減少させる。一方,異なる生物情報源からの信頼できる交差標準は,代替処理の局所ランダム誤差を減少させることができる。シミュレーションデータと実際の酵母PINへの新しいアルゴリズムの適用は,精度の著しい改善を示した。著者らの研究は,「生物学的文脈」に非生物学的方法を置くことがより好ましい結果をもたらすことを強く示唆している。Copyright 2019 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 予測 ,  直列接続 ,  ゲノム ,  *タンパク質 ,  親和性 ,  人工知能 ,  *ネットワーク ,  *相互作用 ,  *アルゴリズム ,  検出法 ,  *酵母 ,  計算機シミュレーション ,  *考古学
準シソーラス用語： 配列アライメント ,  ハイスループット ,  *蛋白質間相互作用 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 信号理論  (ND02020G)

タイトルに関連する用語 (8件)： 酵母 ,  蛋白質相互作用 ,  統合 ,  マルチ ,  ソース ,  生物学 ,  考古学 ,  アルゴリズム