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J-GLOBAL ID：201902272424781265   整理番号：19A0654735

ヒト細胞の還元トランスクリプトームを用いた廃水から飲料水への水質のベンチマーキング【JST・京大機械翻訳】

Benchmarking Water Quality from Wastewater to Drinking Waters Using Reduced Transcriptome of Human Cells

著者 (6件)： Xia Pu (State Key Laboratory of Pollution Control & Resource Reuse, School of the Environment, Nanjing University, PR China) ,  Zhang Xiaowei (State Key Laboratory of Pollution Control & Resource Reuse, School of the Environment, Nanjing University, PR China) ,  Zhang Hanxin (State Key Laboratory of Pollution Control & Resource Reuse, School of the Environment, Nanjing University, PR China) ,  Wang Pingping (State Key Laboratory of Pollution Control & Resource Reuse, School of the Environment, Nanjing University, PR China) ,  Tian Mingming (State Key Laboratory of Pollution Control & Resource Reuse, School of the Environment, Nanjing University, PR China) ,  Yu Hongxia (State Key Laboratory of Pollution Control & Resource Reuse, School of the Environment, Nanjing University, PR China)
資料名： Environmental Science & Technology  (Environmental Science & Technology)
巻： 51  号： 16  ページ： 9318-9326  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0839A  ISSN： 0013-936X  CODEN： ESTHA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 環境科学における主要な課題の一つは,複雑な環境混合物のリスクを監視し評価することである。限られた重要な毒性エンドポイントを有するin vitroバイオアッセイは,廃水および再生水における有機汚染物質の混合物の評価に適していることが示されている。トランスクリプトームはゲノムスケールで生物学的影響を監視できる。しかし,有機微量汚染物質の混合物の評価において,オミクス法を適用した研究はほとんどない。ここでは,ヒト細胞における廃水から飲料水までの範囲の10の水試料の生物活性を,減少したヒトトランスクリプトーム(RHT)アプローチと用量反応モデル化によりプロファイリングするためのオミクスアプローチを開発した。1200の選択された遺伝子の転写発現を,各試料の8つの連続希釈に曝露された2つの細胞系,HepG2とMCF7におけるAmpliSeq技術によって測定した。濃度効果モデルを用いて,差次的に発現した遺伝子(DEG)を同定し,DEGの効果濃度(EC)を計算した。これは低用量応答を調べるためにランク付けできた。さらに,異なる試料により破壊された分子経路を,遺伝子オントロジー(GO)濃縮分析により評価した。HepG2とMCF7の両方を利用する生物活性を表すためのRHTの能力は,以前のin vitroバイオアッセイの結果に匹敵することが示された。最後に,RHT分析によって示された混合物の相対的な可能性は試料の化学的プロファイルと一致した。ヒト細胞によるRHT分析は,微量汚染物質の混合物をベンチマーキングするための効率的で費用対効果の高い方法を提供し,水中の混合物毒性の評価に新しい洞察を提供する可能性がある。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *廃水 ,  *トランスクリプトーム ,  *ヒト ,  ゲノム ,  等級づけ ,  バイオアッセイ ,  HepG2細胞 ,  毒性 ,  in vitro実験 ,  生物活性 ,  *飲用水
準シソーラス用語： プロファイリング ,  オミックス ,  有機汚染物質 ,  *ベンチマーキング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： その他の汚染原因物質  (SB05040W) ,  水質調査測定一般  (SB02060X)

タイトルに関連する用語 (8件)： ヒト ,  細胞 ,  還元 ,  トランスクリプトーム ,  廃水 ,  飲料水 ,  水質 ,  ベンチマーキング