工業的文脈で使用される全ゲノム配列決定はSalmonella実験室の交差汚染を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Rouzeau-Szynalski Katia; Barretto Caroline; Fournier Coralie; Moine Deborah; Gimonet Johan; Baert Leen

文献

J-GLOBAL ID：201902272579052797 整理番号：19A0976443

工業的文脈で使用される全ゲノム配列決定はSalmonella実験室の交差汚染を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Whole genome sequencing used in an industrial context reveals a Salmonella laboratory cross-contamination

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巻： 298 ページ： 39-43 発行年： 2019年
JST資料番号： A0434C ISSN： 0168-1605 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

2013年に,食品試料について行われたルーチンの実験室分析の間,ヨーロッパ工場からの1つの最終製品がSalmonella Hadarに対して陽性であることが試験された。同じ期間において,同じ実験室における1つの環境分離株は,血清型Salmonella Hadarであった。このイベントの前に,実験室はNCTC9877Salmonella Hadarをスパイクした試料を含む熟練度試験を行った。Salmonella Hadar検出のconcomitは,実験室熟練試験で使用されたSalmonella Hadar分離株と同じ実験室による最終製品で見出されたSalmonella Hadar分離株の間の実験室交差汚染の疑いをもたらした。古典的な表現型セロタイピング法は,一般的な抗原式を有するSalmonella分離株に対する血清型を特性化することができるが,亜種内の同じ血清型の株を区別することができないため,全ゲノム配列決定を用いて実験室交差汚染仮説を試験した。さらに,ヨーロッパにおけるこの血清型のゲノム多様性をより良く理解するために,イベントの時間まで利用可能な公共データベースからの12のSalmonella Hadarを全ゲノム配列解析に含めた。分析の結果は,実験室と最終製品から得られた分離株間の10個の一塩基多型(SNP)の最大値を示し,実験室交差汚染を確認した。これらの結果は工場で行われたすべての追加的研究と組み合わせて,生産された最終製品バッチを放出することを可能にし,従って工場のための不要な食品廃棄物と経済的損失を回避した。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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食品の汚染

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