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J-GLOBAL ID：201902272814810575   整理番号：19A2663245

サツマイモ(Ipomoea batatas(L.)Lam.)における収量とゾウムシ抵抗性に関するゲノムワイド関連研究(GWAS)【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Association Studies (GWAS) for Yield and Weevil Resistance in Sweet potato (Ipomoea batatas (L.) Lam)

著者 (6件)： Okada Yoshihiro (Kyushu Okinawa Agricultural Research Center, NARO, Itoman, Okinawa, Japan) ,  Monden Yuki (Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Okayama, Japan) ,  Nokihara Kanoko (Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Okayama, Japan) ,  Shirasawa Kenta (Kazusa DNA Research Institute, Kisarazu, Chiba, Japan) ,  Isobe Sachiko (Kazusa DNA Research Institute, Kisarazu, Chiba, Japan) ,  Tahara Makoto (Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Okayama, Japan)
資料名： Plant Cell Reports  (Plant Cell Reports)
巻： 38  号： 11  ページ： 1383-1392  発行年： 2019年 
JST資料番号： E0975A  ISSN： 0721-7714  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らは,GWASをサツマイモゲノムに適用し,収量と雑草耐性に関連するSNPを同定した。サツマイモ(Ipomoea batatas(L.)Lam)は,高度にヘテロ接合性,異系交配,倍数体種であり,遺伝的分析のための挑戦を提示する。したがって,ゲノムワイド関連研究(GWAS)はサツマイモゲノムの研究に適用できると考えた。2013年に日本の2つの場所(熊本県と沖縄県)において2つのサツマイモ品種[Purle Sweet Lord(PSL)と90IDN-47]の収量を評価し,収量スコアをGWASに用いた。結果は,PSLにおける有意閾値以上のいくつかの一塩基多型(SNP)があることを示した。2つのピークは,それぞれ,PSLのIb03-3とIb01-4連鎖群上の熊本と沖縄で検出された。90IDN-47に関しては,1つの比較的高いピークが,Ib13-8連鎖群上の熊本において検出された。興味深いことに,有意性閾値以上の高いピークは,PSLにおける熊本と沖縄で検出されたが,ピークは異なる連鎖群に位置した。この結果は,収量を制御する遺伝的領域が環境条件に応じて変化する可能性があることを示唆している。さらに,著者らは,沖縄におけるサツマイモ栽培における最大の問題である植物に対する雑草被害の程度を調査した。この実験において,SNPは有意閾値以上で同定されなかった。しかし,90IDN-47遺伝子型において1つの比較的高いピークが見られ,これはweevilに対する耐性を示した。一方,1つの比較的高いピークもPSL遺伝子型で検出され,それはweevilに対する感受性を示した。これらの結果は,2つの地域が雑草耐性に影響を及ぼし,雑草耐性を制御する遺伝子を含む可能性があることを示唆する。Copyright 2019 Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 感受性 ,  遺伝子 ,  *ゲノムワイド関連解析 ,  一塩基多型 ,  栽培 ,  異系交配 ,  品種 ,  遺伝 ,  沖縄県 ,  倍数体 ,  雑草 ,  遺伝子型 ,  *ゲノム ,  *サツマイモ ,  連鎖群

著者キーワード (4件)： ゲノム解析 ,  Convolvulaceae ,  Cylas Formicarius ,  Euscepes Postfasciatus

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  作物の品種改良  (FC02030G)

タイトルに関連する用語 (7件)： サツマイモ ,  Ipomoea ,  収量 ,  抵抗性 ,  ゲノム ,  研究 ,  GWAS