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J-GLOBAL ID：201902273342179384   整理番号：19A1058802

キマメにおける種子蛋白質含量のための配列ベースマーカーの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of sequence-based markers for seed protein content in pigeonpea

著者 (9件)： Obala Jimmy (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India) ,  Obala Jimmy (University of KwaZulu-Natal, African Center for Crop Improvement, Pietermaritzburg, South Africa) ,  Saxena Rachit K. (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India) ,  Singh Vikas K. (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India) ,  Kumar C. V. Sameer (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India) ,  Saxena K. B. (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India) ,  Tongoona Pangirayi (University of KwaZulu-Natal, African Center for Crop Improvement, Pietermaritzburg, South Africa) ,  Sibiya Julia (University of KwaZulu-Natal, African Center for Crop Improvement, Pietermaritzburg, South Africa) ,  Varshney Rajeev K. (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Hyderabad, India)
資料名： Molecular Genetics and Genomics  (Molecular Genetics and Genomics)
巻： 294  号： 1  ページ： 57-68  発行年： 2019年 
JST資料番号： C0025C  ISSN： 1617-4615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Pigeonエンドウは,世界的に10億人を超える食事蛋白質の重要な供給源であるが,作物における種子蛋白質含有量(SPC)の遺伝的増強は,長い間,限られた注意を受けてきた。ゲノム支援育種の利用はSPCに対する遺伝的利得の加速を促進する。しかし,この作物において,この重要な形質に関連する遺伝子マーカーも遺伝子も同定されていない。したがって,本研究は,SPCに対する配列に基づくマーカーと関連する候補遺伝子を同定するために,4つのpigeonエンドウ遺伝子型(12X被覆率)の全ゲノム再配列決定(WGRS)データを利用した。SPCに関する遺伝子機能の知識と入手可能なWGRSデータに共通の変異体フィルタリング戦略を組み合わせることにより,57の遺伝子から108の配列変異体を同定した。これらの遺伝子は,2つのカテゴリーだけに属する56%の19のGO分子機能カテゴリーに割り当てられた。さらに,Sanger配列決定は37遺伝子の変異体の75.4%の存在を確認した。CAPS/dCAPSマーカーに変換された30の配列変異体のうち,17は低いSPC遺伝子型と高いSPC遺伝子型の間の高いレベルの多型を示した。交差ICP5529(高SPC)×ICP11605(低SPC)のF_2母集団における多形CAPS/dCAPSマーカーの16の分析は,CAPS/dCAPSマーカーの4つを有意に(P<0.05)SPCと共分離した。要約すると,4つの遺伝子における突然変異から誘導された4つのマーカーは,マメ科作物改良プログラムにおけるSPCを強化/制御するために有用である。Copyright 2018 Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 突然変異 ,  母集団 ,  育種 ,  ゲノム ,  遺伝子型 ,  遺伝子 ,  農作物 ,  遺伝 ,  *キマメ ,  利得 ,  被覆率 ,  エンドウ
準シソーラス用語： 増幅切断多型配列 ,  候補遺伝子 ,  遺伝子マーカ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 種子蛋白質含量 ,  Cajanus Cajan ,  全ゲノム再配列 ,  次世代シークエンシング ,  配列変異体 ,  共通バリアント分析

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： キマメ ,  種子蛋白質 ,  含量 ,  マーカー ,  開発