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J-GLOBAL ID：201902273869251389   整理番号：19A0494718

広範なハプロタイプ共有とホモ接合性の長い領域を示すオランダにおける遺伝的集団分離株【JST・京大機械翻訳】

A Genetic Population Isolate in The Netherlands Showing Extensive Haplotype Sharing and Long Regions of Homozygosity

著者 (11件)： Somers Metten (Brain Center Rudolf Magnus, Department of Psychiatry, University Medical Center Utrecht, Utrecht 3584 CX, The Netherlands) ,  Loohuis Loes M. Olde (Center for Neurobehavioral Genetics, Semel Institute for Neuroscience and Human Behavior, University of California Los Angeles, Los Angeles, CA 90095, USA) ,  Aukes Maartje F. (Brain Center Rudolf Magnus, Department of Psychiatry, University Medical Center Utrecht, Utrecht 3584 CX, The Netherlands) ,  Pasaniuc Bogdan (Department of Human Genetics, David Geffen School of Medicine at UCLA, University of California Los Angeles, Los Angeles, CA 90095, USA) ,  Pasaniuc Bogdan (Department of Pathology and Laboratory Medicine, University of California Los Angeles, Los Angeles, CA 90095, USA) ,  Visser Kees C. L. de (Department of General Practice, University Medical Center Groningen, University of Groningen, Groningen 9713 GZ, The Netherland) ,  Kahn Rene S. (Brain Center Rudolf Magnus, Department of Psychiatry, University Medical Center Utrecht, Utrecht 3584 CX, The Netherlands) ,  Sommer Iris E. (Brain Center Rudolf Magnus, Department of Psychiatry, University Medical Center Utrecht, Utrecht 3584 CX, The Netherlands) ,  Ophoff Roel A. (Brain Center Rudolf Magnus, Department of Psychiatry, University Medical Center Utrecht, Utrecht 3584 CX, The Netherlands) ,  Ophoff Roel A. (Center for Neurobehavioral Genetics, Semel Institute for Neuroscience and Human Behavior, University of California Los Angeles, Los Angeles, CA 90095, USA) ,  Ophoff Roel A. (Department of Human Genetics, David Geffen School of Medicine at UCLA, University of California Los Angeles, Los Angeles, CA 90095, USA)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 5  ページ： 133  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝的に分離された個体群は,遺伝子解析を容易にする可能性があり,複雑な形質へのマッピング遺伝子の力を改善するために活用できる。本研究の目的は,地理的隔離と宗教の歴史を持つ個体群が,オランダにおける最も高い稔性率の1つを持つ個体群が,遺伝的隔離の徴候を示す程度を試験することであった。この目的のために,ゲノム全体の遺伝子型データを,オランダの104人の無作為対照被験者のサンプルと同様に,この集団からの72人の無関係な個人から収集した。異なる個体群と個体群分離株からの付加的参照データは,HapMapとヒトゲノム多様性プロジェクトを通して利用可能であった。著者らは,これらの個体群間の遺伝的構造を比較するために多くの分析を行った:個体群間のペアワイズ遺伝的距離を計算し,同一-降下(IBD)共有の程度を調べ,有効な個体群サイズを推定した。この個体群の遺伝分析は,試験した全てのレベルで個体群分離株の一貫したパターンを示した。著者らは,この集団がオランダの対照被験者に最も密接に関連しており,以前に記述された集団分離株において観察されたよりも等しいまたはより高いレベルでホモ接合性の高いレベルを検出したことを確認した。この個体群の有効な個体群サイズは,オランダの対照試料のそれより数桁小さいと推定された。著者らは,急速な個体群成長と組み合わせたこの個体群の地理的分離が,将来の遺伝学的研究のための大きな潜在的価値を持つ遺伝的分離株をもたらしたと結論する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 宗教 ,  *ハプロタイプ ,  ゲノム ,  稔性 ,  *遺伝 ,  個体群 ,  遺伝子 ,  プロジェクト ,  *オランダ王国 ,  遺伝子型 ,  地理学
準シソーラス用語： 遺伝距離 ,  隔離 ,  遺伝子解析 ,  *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝的分離物 ,  連鎖不平衡 ,  ホモ接合性の実行 ,  IBD共有 ,  効果的な集団サイズ

分類 (3件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (41件)：

• Peltonen, L.; Palotie, A.; Lange, K. Use of population isolates for mapping complex traits. Nat. Rev. Genet. 2000, 1, 182-190.
• Service, S.; DeYoung, J.; Karayiorgou, M.; Roos, J.L.; Pretorious, H.; Bedoya, G.; Ospina, J.; Ruiz-Linares, A.; Macedo, A.; Palha, J.A.; et al. Magnitude and distribution of linkage disequilibrium in population isolates and implications for genome-wide association studies. Nat. Genet. 2006, 38, 556-560.
• Axenovich, T.I.; Zorkoltseva, I.V.; Belonogova, N.M.; Struchalin, M.V.; Kirichenko, A.V.; Kayser, M.; Oostra, B.A.; van Duijn, C.M.; Aulchenko, Y.S. Linkage analysis of adult height in a large pedigree from a Dutch genetically isolated population. Hum. Genet. 2009, 126, 457-471.
• Panoutsopoulou, K.; Tachmazidou, I.; Zeggini, E. In search of low-frequency and rare variants affecting complex traits. Hum. Mol. Genet. 2013, 22, R16-R21.
• Aulchenko, Y.S.; Heutink, P.; Mackay, I.; Bertoli-Avella, A.M.; Pullen, J.; Vaessen, N.; Rademaker, T.A.M.; Sandkuijl, L.A.; Cardon, L.; Oostra, B.; et al. Linkage disequilibrium in young genetically isolated Dutch population. Eur. J. Hum. Genet. 2004, 12, 527-534.

タイトルに関連する用語 (7件)： ハプロタイプ ,  共有 ,  ホモ接合性 ,  オランダ ,  遺伝 ,  集団 ,  分離株