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J-GLOBAL ID：201902274395972130   整理番号：19A2048174

生存におけるその必須性を決定するためのMycobacterium tuberculosis H_37RvのRv3906C遺伝子の構造予測と変異解析【JST・京大機械翻訳】

Structural Prediction and Mutational Analysis of Rv3906c Gene of Mycobacterium tuberculosis H₃₇Rv to Determine Its Essentiality in Survival

著者 (5件)： Beg Md. Amjad (Centre for Interdisciplinary Research in Basic Science, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi 110025, India) ,  Beg Md. Amjad (CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology, Mall Road, Delhi 110007, India) ,  Shivangi (CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology, Mall Road, Delhi 110007, India) ,  Thakur Sonu Chand (Centre for Interdisciplinary Research in Basic Science, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi 110025, India) ,  Meena Laxman S. (CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology, Mall Road, Delhi 110007, India)
資料名： Advances in Bioinformatics (Web)  (Advances in Bioinformatics (Web))
巻： 2018  ページ： Null  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7653A  ISSN： 1687-8027  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結核の出現はピークにある;したがって,それをより低いレベルにステーションするために,著者らはMycobacterium tuberculosis[M.tuberculosis]病因に対する生物情報学的アプローチを試みた。Rv3906cはM.tuberculosisの保存された仮想遺伝子であり,多くのGTP結合蛋白質モチーフDXXGを含み,この遺伝子がGTP結合またはGTP加水分解様式でプロセシングされることを示す。この遺伝子は,その隣接遺伝子との相互作用を示し,ポリメラーゼであり,細胞外領域に局在し,可溶性蛋白質であることが分かった。Rv3906cは種々の位置でカルシウム原子に結合ポケットを有し,カルシウムがこの遺伝子の過程で何らかの役割を持つ可能性があることを証明する。GTP結合蛋白質モチーフDXXGは種々の位置に存在し,カルシウムは0.25のCスコアでこの部位に結合する。このモチーフに関する変異解析は,グリシンによるアスパラギン酸残基の変異後の安定性の大きな減少を示す。pHや温度のようなストレス条件も蛋白質の安定性を変化させた。この位置での安定性の低下は,病原体の生存の阻害に役割を果たしている可能性がある。この遺伝子のこれらの計算研究は,結核に対する薬物開発に向けた成功段階である可能性がある。Copyright 2018 Md. Amjad Beg et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 病因 ,  タンパク質 ,  *遺伝子 ,  カルシウム ,  結核 ,  *変異 ,  結合部位 ,  病原体 ,  *Mycobacterium ,  相互作用 ,  *結核菌 ,  加水分解 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸
準シソーラス用語： スコア ,  *変異解析 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (1件)： グリシン

引用文献 (56件)：

• D. G. Russell, "Mycobacterium tuberculosis: here today, and here tomorrow," Nature Reviews Molecular Cell Biology, vol. 2, no. 8, pp. 569-586, 2001.
• C. E. Barry III, H. I. Boshoff, V. Dartois, "The spectrum of latent tuberculosis: rethinking the biology and intervention strategies," Nature Reviews Microbiology, vol. 7, no. 12, pp. 845-855, 2009.
• H. Esmail, C. E. Barry, D. B. Young, R. J. Wilkinson, "The ongoing challenge of latent tuberculosis," Philosophical Transactions of the Royal Society B, 2014, 20130437.
• J. Pieters, "Mycobacterium tuberculosis and the macrophage: maintaining a balance," Cell Host & Microbe, vol. 3, no. 6, pp. 399-407, 2008.
• World Health Organization, Global Tuberculosis Report 2015, WHO, 2016.

タイトルに関連する用語 (5件)： 生存 ,  Mycobacterium ,  遺伝子 ,  構造予測 ,  変異解析