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J-GLOBAL ID：201902274687080514   整理番号：19A0506700

ICE-seqを用いたA-to-I RNAエディティング部位のトランスクリプトーム全体同定【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome-wide identification of A-to-I RNA editing sites using ICE-seq

著者 (4件)： Okada Shunpei (Department of Chemistry and Biotechnology, Graduate School of Engineering, University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8656, Japan) ,  Ueda Hiroki (Biological Data Science Division, Research Center for Advanced Science and Technology (RCAST), University of Tokyo, Tokyo 153-8904, Japan) ,  Noda Yuta (Department of Chemistry and Biotechnology, Graduate School of Engineering, University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8656, Japan) ,  Suzuki Tsutomu (Department of Chemistry and Biotechnology, Graduate School of Engineering, University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8656, Japan)
資料名： Methods  (Methods)
巻： 156  ページ： 66-78  発行年： 2019年 
JST資料番号： W0241A  ISSN： 1046-2023  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： A-to-I RNA編集において,アデノシンはRNAの二本鎖領域においてイノシンに変換される。インシンは,豊富なepitran的標識であり,転写後に遺伝子発現を調節することにより広範囲の生物学的過程に寄与する。A-to-I RNA編集の効果を理解するために,inosineの正確なマッピングが必要である。この目的のために,トランスクリプトームを通してAからI RNA編集部位の不偏で信頼できる同定を可能にするイノシン化学消去配列決定(ICE-seq)と呼ばれる生化学的方法を確立した。ここでは,ヒトトランスクリプトームにおけるICE-seqに対する著者らの最新プロトコルについて述べた。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  *RNAエディティング ,  *トランスクリプトーム ,  生化学 ,  ヒト ,  *編集 ,  遺伝子発現 ,  プリンヌクレオシド ,  リボヌクレオシド ,  診断用薬
準シソーラス用語： ハイスループット ,  生物学的過程 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： A-to-I RNA編集 ,  ICE-seq ,  ハイスループットシークエンシング

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (2件)： イノシン ,  アデノシン

タイトルに関連する用語 (4件)： ICE ,  RNAエディティング ,  トランスクリプトーム ,  同定