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J-GLOBAL ID:201902275415876623   整理番号:19A1804102

ガスクロマトグラフィー-質量分析に基づく非標的メタボロミクスにおけるバイオマーカー発見に対する正規化法の影響:何が考慮すべきか?【JST・京大機械翻訳】

Influences of Normalization Method on Biomarker Discovery in Gas Chromatography-Mass Spectrometry-Based Untargeted Metabolomics: What Should Be Considered?
著者 (19件):
資料名:
巻: 89  号: 10  ページ: 5342-5348  発行年: 2017年 
JST資料番号: A0395A  ISSN: 0003-2700  CODEN: ANCHAM  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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ガスクロマトグラフィー-質量分析に基づく非標的化メタボロミクスにおけるデータ削減技術は,データ解析の次のワークフローをより多くのものにしている。しかし,正規化プロセスはまだ研究者をperplexesし,その効果は常に無視されている。正規化法の影響を明らかにするために,5つの代表的正規化法(質量分析総有用信号,中央値,確率論的指数正規化,望ましくない変動ランダム,および系統的比率正規化)を,異なるタイプの3つの実際のデータセットで比較した。最初に,データ削減技術を用いて,オリジナルデータを精製した。次に,品質管理サンプルと相対的ログ豊度プロットを用いて,望ましくない変動と正規化プロセスの効率を評価した。さらに,マンホイットニーU試験,受信者動作特性曲線解析,ランダムフォレスト,および異なる正規化データセットにおける特徴選択アルゴリズムBorutaによってスクリーニングされた潜在的バイオマーカーを比較した。結果は,一般的に受け入れられた規則が満たしやすいので,正規化法の決定が困難であることを示した。しかし,異なる正規化法は,潜在的バイオマーカーの種類と数の両方に影響を及ぼさなかった。最後に,正規化法選択のための統合戦略を推奨した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
各種分析法一般  ,  有機化合物の各種分析  ,  生体物質一般 

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