文献

J-GLOBAL ID：201902275714253284   整理番号：19A1806138

GCN4pの核磁気共鳴構造はイオン対が酸性pHで破壊されるが,コイル状コイルスーパーヘリックスの緩和を示す【JST・京大機械翻訳】

Nuclear Magnetic Resonance Structures of GCN4p Are Largely Conserved When Ion Pairs Are Disrupted at Acidic pH but Show a Relaxation of the Coiled Coil Superhelix

著者 (5件)： Kaplan Anne R. (Department of Molecular and Cell Biology, University of Connecticut, Connecticut, United States) ,  Brady Megan R. (Department of Molecular and Cell Biology, University of Connecticut, Connecticut, United States) ,  Maciejewski Mark W. (Department of Molecular Biology and Biophysics, UConn Health, Connecticut, United States) ,  Kammerer Richard A. (Laboratory of Biomolecular Research, Division of Biology and Chemistry, Paul Scherrer Institut, Switzerland) ,  Alexandrescu Andrei T. (Department of Molecular and Cell Biology, University of Connecticut, Connecticut, United States)
資料名： Biochemistry  (Biochemistry)
巻： 56  号： 11  ページ： 1604-1619  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0270B  ISSN： 0006-2960  CODEN： BICHAW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コイルドコイルの安定化における役割イオン対を理解するために,3つのpH値におけるGCN4pの核磁気共鳴構造を決定した。pH6.6で,全ての酸性残基は完全に荷電した;pH4.4では,それらは半荷電で,pH1.5ではプロトン化され,非荷電である。GCN4pのα-ヘリックス単量体とコイル状コイル構造は,pHの減少に伴うコイル状コイル四次構造のゆるみを除いて,大部分保存されている。中性から酸性pHへの違いは,(i)鎖間イオン対接触の損失により引き起こされたコイル状コイル超螺旋の巻き戻し,(ii)二量体中の単量体の分離の小さな増加,(iii)中性pHでのイオン対に関与する反対電荷残基間の分離の増加,を含む。GCN4pの化学シフト(HN,N,C′,Cα,及びCβ)はαヘリックス構造と一致する7残基周期性を示し,pHと共に不変であった。対照的に,中性pHでの水素交換速度の周期性は交換機構がEX1領域に移動すると酸性pHで失われる。1H-15N核オーバーハウザー効果緩和測定に基づいて,α-ヘリックス単量体は酸性pHでピコ秒からナノ秒骨格動力学へのわずかな増加を経験した。対照的に,13C回転フレームT_1緩和(T_1ρ)データは,特にイオン対を通してコイル状コイル二量体化界面を安定化する残基に対して,より低いpHでピコ秒からナノ秒側鎖動力学への増加を示した。pH値の範囲にわたるGCNp4の構造と動力学に関する結果は,中性pHでの単一構造がコイル状コイルの非折畳み安定性のpH依存性を十分に予測しない理由を合理化する助けとなる。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ピコ秒 ,  *イオン対 ,  pH【水素イオン指数】 ,  ナノ秒 ,  デコンボリューション ,  pH依存性 ,  単量体 ,  側鎖 ,  プロトン化 ,  *緩和現象 ,  *NMR【磁気共鳴】 ,  四次構造 ,  *超螺旋 ,  電荷
準シソーラス用語： 残基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： 核磁気共鳴 ,  イオン対 ,  酸性 ,  pH ,  破壊 ,  コイル状コイル ,  スーパーヘリックス ,  緩和