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J-GLOBAL ID：201902276297155582   整理番号：19A1817269

従来型および有機栽培系の土壌からのMicrobiotaにおける微生物多様性および抗菌剤耐性プロファイル【JST・京大機械翻訳】

Microbial Diversity and Antimicrobial Resistance Profile in Microbiota From Soils of Conventional and Organic Farming Systems

著者 (10件)： Armalyte Julija (Life Sciences Center, Institute of Biosciences, Vilnius University, Vilnius, Lithuania) ,  Skerniskyte Jurate (Life Sciences Center, Institute of Biosciences, Vilnius University, Vilnius, Lithuania) ,  Bakiene Elena (Life Sciences Center, Institute of Biosciences, Vilnius University, Vilnius, Lithuania) ,  Krasauskas Renatas (Life Sciences Center, Institute of Biosciences, Vilnius University, Vilnius, Lithuania) ,  Siugzdiniene Rita (Institute of Microbiology and Virology, Lithuanian University of Health Sciences, Kaunas, Lithuania) ,  Kareiviene Violeta (Institute of Microbiology and Virology, Lithuanian University of Health Sciences, Kaunas, Lithuania) ,  Kerziene Sigita (Institute of Microbiology and Virology, Lithuanian University of Health Sciences, Kaunas, Lithuania) ,  Klimiene Irena (Institute of Microbiology and Virology, Lithuanian University of Health Sciences, Kaunas, Lithuania) ,  Suziedeliene Edita (Life Sciences Center, Institute of Biosciences, Vilnius University, Vilnius, Lithuania) ,  Ruzauskas Modestas (Institute of Microbiology and Virology, Lithuanian University of Health Sciences, Kaunas, Lithuania)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 892  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 土壌は微生物多様性の最大の貯水池の1つであるが,コミュニティダイナミックスを定義するプロセスは完全には理解されていない。農業目的にとって重要な土壌管理とは別に,微生物間の高い複雑性と進行中の競争のために,それは抗微生物耐性の進化と発展のための好ましい環境と考えられている。農業生産への異なるアプローチは,土壌微生物群集組成と抗生物質耐性表現型に対する特異的な結果を持つ可能性がある。したがって,本研究では,異なる処理(無機肥料と農薬対有機質肥料と化学害虫管理なし)により継続的に影響を受ける従来と有機農業システムにおける土壌微生物相とその耐性を比較することを目的とした。土壌微生物群集の比較は,類似の土壌構造とpHを有する2つの農業スタイルの間の細菌の主要な門の間で大きな差異を明らかにしなかった。より低い分類群間のわずかな差異が観察され,土壌コミュニティが安定していることを示し,処理と施肥の異なるスタイルを扱うことができる組成のわずかなシフトがあることを示した。強度のレベルが微生物組成を変化させることがまだ不明であるが,中央ヨーロッパにおける現在の従来の農業は土壌細菌群集に対する許容レベルの強度を示している。土壌の抵抗性が臨床的に関連する土壌由来抗生物質耐性遺伝子の全土壌DNAをスクリーニングすることにより評価されたとき,低い耐性決定因子が検出された(β-ラクタム,アミノグリコシド,テトラサイクリン,エリスロマイシン,リファンピシンに対する耐性)。また,同じ土壌試料を用いて抗生物質耐性培養細菌を分離した。これはPseudomonas,Stenotrophomonas,SphingobacteriumおよびChryseobacterium属の高耐性分離株により優勢であった。これらの分離株の抵抗性は,主にRNDに依存する土壌Pseudomonas spp.,RNDおよびABC輸送体上のStenotrophomonas spp.およびChryseobacterium spp.の排出機構に依存していた。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農業 ,  コミュニティ ,  土壌微生物 ,  *抗細菌薬 ,  培養 ,  DNA【核酸】 ,  *微生物 ,  表現型 ,  マイクロバイオーム ,  細菌群集 ,  微生物薬物耐性 ,  *微生物多様性 ,  シュードモナス属 ,  クリセオバクテリウム属 ,  ステノトロホモナス属 ,  産業
準シソーラス用語： Pseudomonas ,  Chryseobacterium ,  Stenotrophomonas , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 有機および従来の農業 ,  土壌微生物相 ,  抗生物質感受性 ,  耐性遺伝子 ,  排出ポンプ

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

引用文献 (73件)：

• Allen H. K., Moe L. A., Rodbumrer J., Gaarder A., Handelsman J. (2009). Functional metagenomics reveals diverse beta-lactamases in a remote Alaskan soil. ISME J. 3 243-251. doi: 10.1038/ismej.2008.86
• Amann R. I., Ludwig W., Schleifer K. H. (1995). Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation. Microbiol. Rev. 59 143-169. doi: 10.1038/ismej.2008.86
• Bartram A. K., Jiang X., Lynch M. D. J., Masella A. P., Nicol G. W., Dushoff J., et al (2014). Exploring links between pH and bacterial community composition in soils from the Craibstone Experimental Farm. FEMS Microbiol. Ecol. 87 403-415. doi: 10.1111/1574-6941.12231
• Baveye P. C. (2009). To sequence or not to sequence the whole-soil metagenome? Nat. Rev. Microbiol. 7 756-757. doi: 10.1038/nrmicro2119-c2
• Bengtsson-Palme J., Larsson D. G. J. (2016). Concentrations of antibiotics predicted to select for resistant bacteria: proposed limits for environmental regulation. Environ. Int. 86 140-149. doi: 10.1016/j.envint.2015.10.015

タイトルに関連する用語 (7件)： 有機栽培 ,  土壌 ,  Microbiota ,  微生物多様性 ,  抗菌剤 ,  耐性 ,  プロファイル