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J-GLOBAL ID：201902277011417444   整理番号：19A0805701

肺同種移植片の気道トランスクリプトーム解析と免疫プロテオームプロファイリングは慢性肺同種移植片機能不全における新規免疫シグネチャを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Airway Transcriptome Analysis and Immune Proteome Profiling of the Lung Allograft Reveals Novel Immune Signatures in Chronic Lung Allograft Dysfunction

著者 (12件)： Iasella C.J. (Department of Pharmacy and Therapeutics, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Hoji A. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Zhang Y. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Xu W. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Chen K. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Brown M. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Lendermon E. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Johnson B.A. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Kilaru S. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Morrell M.R. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  Pilewski J.M. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA) ,  McDyer J.F. (Department of Medicine, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA)
資料名： Journal of Heart and Lung Transplantation  (Journal of Heart and Lung Transplantation)
巻： 38  号： 4 S  ページ： S30  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3128A  ISSN： 1053-2498  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 慢性肺同種移植片機能不全(CLAD)は,肺移植レシピエント(LTRs)における長期生存に対する主要な制限である。CLADを駆動する基礎となる生物学的機構はほとんど理解されていない。分子レベルでのCLADの病因に取り組むために,気道ブラシ試料のRNA-seq分析および気管支洗浄(BAL)試料におけるMeso Scale Discovery(MSD)多重サイトカインおよびケモカイン測定を行った。全RNAを遠位気管支ブラシ試料から抽出し,Illumina装置を用いて配列決定し,潜在的バッチ効果に対する補正による示差遺伝子発現(DGE)プロファイリングのためにその後分析したバルクRNA-seqデータを得た。DGEプロファイルの遺伝子濃縮と遺伝子および細胞オントロジー分析を行い,活性化シグナル経路の正準経路および細胞上流規則性を予測するために用いた。偽発見率(FDR)p<0.05は,CLAD試料において有意に過剰発現した発現を識別した。上流調節因子分析では,p<0.05の2.00以上のzスコアスコアが有意であった。対応するLTRからのBALは,多重MSDサイトカインとケモカイン配列を受けた。マンホイットニーU試験を使用し,p<0.05の検体は有意であると考えられた。21のCLADと18の安定した制御LTRを,RNA-seq分析のために含んだ。対応するMSD測定を,17のCLADと11の対照BALサンプルで行った。1031のDEGは,CLAD試料で過剰発現した。遺伝子解析により,Type-1適応免疫応答と炎症性の濃縮が明らかになった。TNF-α(p<1.09E-41),IL-1β(p<5.24E-40),IL-1α(p<8.71E-24),STAT1(p<7.96E-31),およびIFN-γ(p<7.07E-45)は,CLADで上方制御された重要な免疫経路として同定された。BALのMSD蛋白質多重分析は,CLAD LTRにおいてI型サイトカインIL-12/IL23p40(p<0.01)およびTNF-α(p<0.007),炎症性成分,IL-1β(p<0.03)およびB細胞調節性サイトカインIL-21(p<0.001)の有意な増加を示した。トランスクリプトーム解析と肺同種移植BAL免疫プロテオームは,CLAD対対照で一般的な免疫活性化経路への新しい洞察を提供する。さらなる分析は,CLADにおける免疫標的を選択し,CLAD内の異なる免疫内型を明らかにするための根拠を提供する可能性がある。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： インターロイキン1 ,  多重化 ,  遺伝子 ,  病因 ,  ケモカイン ,  遺伝子発現 ,  *同種移植 ,  炎症 ,  タンパク質 ,  *プロテオーム ,  *機能障害 ,  TNFα ,  RNA-seq ,  分子遺伝現象
準シソーラス用語： *プロファイリング ,  *同種移植片 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 呼吸器疾患の外科療法  (GI05030U)

タイトルに関連する用語 (8件)： 肺 ,  同種移植片 ,  気道 ,  トランスクリプトーム解析 ,  免疫 ,  慢性 ,  機能不全 ,  シグネチャ