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J-GLOBAL ID：201902277776952688   整理番号：19A2013645

let-7a,miR-34a,およびmiR-199a/bのバイオインフォマティクス機能解析は,肝細胞癌に対する免疫系経路および癌特徴に対する新しい洞察を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics functional analysis of let-7a, miR-34a, and miR-199a/b reveals novel insights into immune system pathways and cancer hallmarks for hepatocellular carcinoma

著者 (7件)： Soliman Bangly (Department of Biochemistry, Faculty of Science, Ain Shams University, Cairo, Egypt) ,  Soliman Bangly (Informatics and Systems Department, Biomedical Informatics and Chemo-Informatics Group, Centre of Excellence for Advanced Sciences (CEAS), Division of Engineering Research, National Research Centre, Cairo, Egypt) ,  Salem Ahmed (Department of Biochemistry, Faculty of Science, Ain Shams University, Cairo, Egypt) ,  Ghazy Mohamed (Department of Biochemistry, Faculty of Science, Ain Shams University, Cairo, Egypt) ,  Abu-Shahba Nourhan (Stem Cells Research Group, Medical Centre of Excellence, Medical Molecular Genetics Department, National Research Centre, Cairo, Egypt) ,  El Hefnawi Mahmoud (Informatics and Systems Department, Biomedical Informatics and Chemo-Informatics Group, Centre of Excellence for Advanced Sciences (CEAS), Division of Engineering Research, National Research Centre, Cairo, Egypt) ,  El Hefnawi Mahmoud (Centre for Informatics, Nile University, Sheikh Zayed City, Egypt)
資料名： Tumor Biology  (Tumor Biology)
巻： 40  号： 5  ページ： 1010428318773675  発行年： 2018年 
JST資料番号： W1623A  ISSN： 1010-4283  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： let-7a,miR-34a,およびmiR-199a/bは,細胞過程のマスター調節因子として大きな注目を集めている。特に,これら3つのマイクロRNAは,肝細胞癌に対する潜在的な共抑制因子として作用する。バイオインフォマティクスは,標的予測と機能的アノテーション分析を通して,これらのマイクロRNAの機能性を明らかにすることができる。本研究において,革新的なサーバ(ミラーSuite,DAVID,MiRGator V3.0,GeneTrail)を用いたin silico分析は,これらのマイクロRNAの組合せと個々の標的遺伝子を示し,さらに肝細胞癌進行におけるそれらの役割を探求した。ミラー2.0標的予測ツールを用いて3つのマイクロRNAにより調節されると予測された87の共通標的メッセンジャーRNA(p≦0.05)が存在した。加えて,DAVID機能アノテーションとReactomeツールにより行われたこれらの標的の機能的濃縮分析は,2つの主要な免疫関連経路,8つの肝細胞癌特徴関連経路,および免疫系と肝細胞癌特徴の間の相互接続過程を仲介する2つの経路を明らかにした。さらに,予測された共通標的に対する蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークをSTRINGデータベースを用いて得た。MiRGator V3.0とGeneTrailサーバを用いた3つのマイクロRNAの標的遺伝子と経路の個々の分析は,SOX4のようないくつかの新規予測標的癌遺伝子を明らかにした。一般的に,著者らの結果は,let-7a,miR-34a,およびmiR-199a/bが異なる免疫系経路および主要な肝細胞癌の特徴において新しい相互作用を有することを示す。したがって,著者らの知見は,癌サイレンサーとしてのこれらのmiRNAの役割についてより多くの光を明らかにした。Copyright The Author(s) 2018 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  アノテーション ,  相互作用 ,  サイレンサー領域 ,  レプレッサー ,  予測 ,  *肝細胞癌 ,  ネットワーク ,  mRNA ,  ヒト
準シソーラス用語： 標的遺伝子 ,  in silico ,  マイクロRNA ,  調節因子 ,  *免疫系 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ONCOサプレッサのマイクロRNA ,  肝細胞癌 ,  バイオインフォマティクス ,  癌の特徴 ,  免疫系 ,  新しい効果的治療法

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： miR-34a ,  バイオインフォマティクス ,  機能解析 ,  肝細胞癌 ,  免疫系 ,  経路 ,  癌 ,  洞察