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J-GLOBAL ID：201902277784320229   整理番号：19A0488112

Phalaris(Phalaris aquatica L.)の参照トランスクリプトームの生成と特性化【JST・京大機械翻訳】

Generation and Characterisation of a Reference Transcriptome for Phalaris (Phalaris aquatica L.)

著者 (12件)： Baillie Rebecca C. (Agriculture Victoria, AgriBio, the Centre for AgriBioscience, 5 Ring Road, Bundoora, Victoria 3083, Australia) ,  Drayton Michelle C. (Agriculture Victoria, AgriBio, the Centre for AgriBioscience, 5 Ring Road, Bundoora, Victoria 3083, Australia) ,  Pembleton Luke W. (Agriculture Victoria, AgriBio, the Centre for AgriBioscience, 5 Ring Road, Bundoora, Victoria 3083, Australia) ,  Kaur Sukhjiwan (Agriculture Victoria, AgriBio, the Centre for AgriBioscience, 5 Ring Road, Bundoora, Victoria 3083, Australia) ,  Culvenor Richard A. (CSIRO Agriculture Flagship, Canberra, Australian Capital Territory 2601, Australia) ,  Smith Kevin F. (Faculty of Veterinary and Agricultural Sciences, The University of Melbourne, Melbourne, Victoria 3010, Australia) ,  Spangenberg German C. (Agriculture Victoria, AgriBio, the Centre for AgriBioscience, 5 Ring Road, Bundoora, Victoria 3083, Australia) ,  Spangenberg German C. (School of Applied Systems Biology, La Trobe University, Bundoora, Victoria 3086, Australia) ,  Forster John W. (Agriculture Victoria, AgriBio, the Centre for AgriBioscience, 5 Ring Road, Bundoora, Victoria 3083, Australia) ,  Forster John W. (School of Applied Systems Biology, La Trobe University, Bundoora, Victoria 3086, Australia) ,  Cogan Noel O. I. (Agriculture Victoria, AgriBio, the Centre for AgriBioscience, 5 Ring Road, Bundoora, Victoria 3083, Australia) ,  Cogan Noel O. I. (School of Applied Systems Biology, La Trobe University, Bundoora, Victoria 3086, Australia)
資料名： Agronomy (Web)  (Agronomy (Web))
巻： 7  号： 1  ページ： 14  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7129A  ISSN： 2073-4395  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Phalaris aquaticaは,オーストラリアで広く栽培されている寒冷期の多年生草本種であり,世界の他の地域での追加の利用がある。Phalarisは望ましい農業特性を示すが,好ましくない特性には過剰な種子の縮小,アルミニウム毒性に対する感受性,およびいくつかの毒物症症候群が含まれている。品種開発は伝統的な選択法に基づいているが,大規模な配列資源の開発を必要とするゲノムに基づくアプローチの応用から利益を得る。大きな核DNA含量により,ゲノムの発現成分を標的とし,分析の複雑さを減少させる方法は,現在の配列決定技術に最も適している。多様なLandmasterに属する単一植物からの複数の組織のトランスクリプトーム配列決定により,参照単一遺伝子セットを開発した。関連種からの遺伝子補完と参照蛋白質データベースについて比較を行い,異なる組織における遺伝子発現パターンを評価した。望ましくない属性の除去に関連する多数の候補遺伝子を同定した。参照単一遺伝子セットは,潜在的トランスジェニック展開のための候補遺伝子の特異的遺伝子発現と同定の詳細な研究の基礎を提供し,また,phalaris改良のための将来のゲノム支援育種活性を支援する遺伝子型分析のための重要な資源を提供する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  *トランスクリプトーム ,  育種 ,  農業 ,  感受性 ,  遺伝子型 ,  多年生草 ,  イネ科 ,  ゲノム ,  オーストラリア連邦 ,  遺伝子発現 ,  *キャラクタリゼーション
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  *クサヨシ属 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： RNA-seq ,  牧草のハーディング ,  de novo組立 ,  シーケンス注釈 ,  組織特異的遺伝子発現 ,  P.tuberosa ,  イネ科

分類 (2件)： 飼料作物,草地  (FC03050J) ,  自然災害  (FC04020J)

引用文献 (55件)：

• Oram, R.N.; Ferreira, V.; Culvenor, R.A.; Hopkins, A.A.; Stewart, A. The first century of Phalaris aquatica L. cultivation and genetic improvement: A review. Crop Pasture Sci. 2009, 60, 1-15.
• Anderson, M.W.; Cunningham, P.J.; Reed, K.F.M.; Byron, A. Perennial grasses of Mediterranean origin offer advantages for central western Victorian sheep pasture. Aust. J. Exp. Agric. 1999, 39, 275-284.
• Culvenor, R.A. Breeding and use of summer-dormant grasses in Australia, with special reference to phalaris. Crop Sci. 2009, 49, 2335-2346.
• Helyar, K.R.; Anderson, A.J. Effects of lime on the growth of five species, on aluminium toxicity, and on phosphorus availability. Aust. J. Agric. Res. 1971, 22, 707-721.
• McWilliam, J.R. Selection for seed retention in Phalaris tuberosa L. Aust. J. Agric. Res. 1963, 14, 755-764.

タイトルに関連する用語 (4件)： Phalaris ,  参照 ,  トランスクリプトーム ,  特性化