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J-GLOBAL ID：201902278247353950   整理番号：19A1274267

硬質冬コムギにおける斑点病抵抗性に関するゲノムワイド関連研究【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Association Study for Spot Blotch Resistance in Hard Winter Wheat

著者 (6件)： Ayana Girma T. (Department of Agronomy, Horticulture, and Plant Science, South Dakota State University, Brookings, SD, United States) ,  Ali Shaukat (Department of Agronomy, Horticulture, and Plant Science, South Dakota State University, Brookings, SD, United States) ,  Sidhu Jagdeep S. (Department of Agronomy, Horticulture, and Plant Science, South Dakota State University, Brookings, SD, United States) ,  Gonzalez Hernandez Jose L. (Department of Agronomy, Horticulture, and Plant Science, South Dakota State University, Brookings, SD, United States) ,  Turnipseed Brent (Department of Agronomy, Horticulture, and Plant Science, South Dakota State University, Brookings, SD, United States) ,  Sehgal Sunish K. (Department of Agronomy, Horticulture, and Plant Science, South Dakota State University, Brookings, SD, United States)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 9  ページ： 926  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Cochliobolus sativus(アナモルフ:Bipolaris sorokiniana)によって引き起こされるスポット・ブロッチ(SB)は,世界的にコムギの経済的に重要な病気である。重篤な流行状態の下で,病気は70%までの収率損失を引き起こすことができる。SB耐性遺伝子/QTLを同定するための2親マッピングのような以前のアプローチは,多遺伝子形質を検出するためのより低い能力を持つ利用可能な遺伝的多様性の限られた部分のみを利用し,より低いマーカー密度を持っていた。本研究では,294遺伝子型の硬質冬コムギ関連マッピングパネル(HWWAMP)におけるSB耐性に対するゲノムワイド関連研究(GWAS)を行った。HWWAMPをB.sorokiniana(分離株SD40)に対する応答について評価し,10種の耐性,38種の中程度耐性,120種の中程度抵抗性,111種の中程度感受性,15種の感受性遺伝子型で反応の範囲を観察した。15590の高品質SNPと294の遺伝子型を用いたGWASにより,染色体2D,3A,4A,4B,5A,7B上の6QTL(p=<0.001)を同定した。高度に関連したSNPは,すべての6つのQTL,QSb.sdsul-2D.1(SNP:Kukri_c31121_1460,R~2=4%),QSb.sdsuu-4A1(SNP;Kukri_rep_c104877_2166,R2=6%)とQSb.sdsup-7B.1(SN:TA005844-0160,R~2=6%)に対して同定された(SN:Kukri_rep_c104877_2166,R2=6%)。QSb.sudu-7B.1(SNP;TA005844-0160,R2=6%)。著者らの研究は,以前の研究で同定された3つの(2D,5A,および7B)ゲノム領域を検証するだけでなく,マーカー支援選択のための高度に関連したSNPマーカーも提供する。さらに,コムギにおけるSB抵抗性のために,3つの新規QTL(QSb.sdsuu-3A.1,QSb.sudu-4A.1,およびQSb.sdsub-4B1)を同定した。候補領域の遺伝子アノテーション分析により,9つのNBS-LRRと38の他の植物防御関連蛋白質ファミリーを多重QTLにわたって同定し,これらはコムギにおけるSB耐性の微細マッピングとさらなる特性化に使用できた。オオムギとの比較分析はコムギ染色体2D,3A,5Aおよび7B上のSB耐性遺伝子座を示し,オオムギにおける染色体2H,3H,5Hおよび7H上の以前に同定されたSB抵抗性遺伝子座と一致した。著者らの研究で同定された10の高度耐性遺伝子型とSNPマーカーは,コムギにおけるSB耐性の育種のための非常に有用な資源であることができた。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アノテーション ,  キャラクタリゼーション ,  二次元 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  感受性 ,  *ゲノム ,  *コムギ ,  染色体 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  オオムギ ,  *秋播コムギ ,  *硬質
準シソーラス用語： 耐性遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Triticum aestivum ,  硬質冬コムギ ,  スポットブロット ,  GWAS ,  qtls ,  SNPs ,  マーカー支援選択

分類 (2件)： 麦  (FC03033M) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y)

引用文献 (119件)：

• Acharya K., Dutta A. K., Pradhan P. (2011). Bipolaris sorokiniana (Sacc.) Shoem.: the most destructive wheat fungal pathogen in the warmer areas. Aust. J. Crop Sci. 5 1064-1071.
• Adhikari T. B., Gurung S., Hansen J. M., Jackson E. W., Bonman J. M. (2012). Association mapping of quantitative trait loci in spring wheat landraces conferring resistance to bacterial leaf streak and spot blotch. Plant Genome 5 1-16. doi: 10.3835/plantgenome2011.12.0032
• Arruda M. P., Brown P., Brown-Guedira G., Krill A. M., Thurber C., Merrill K. R., et al (2016). Genome-wide association mapping of Fusarium head blight resistance in wheat using genotyping-by-sequencing. Plant Genome 9 1-14. doi: 10.3835/plantgenome2015.04.0028
• Ban T., Singh V., Singh G., Chaudhury A., Ojha A., Tyagi B. S., et al (2016). Phenotyping at hot spots and tagging of QTLs conferring spot blotch resistance in bread wheat. Mol. Biol. Rep. 43 1293-1303. doi: 10.1007/s11033-016-4066-z
• Barnes J., Chen X., Min D., Yasir T. A., Hu Y. G. (2012). Genetic diversity, population structure and linkage disequilibrium in elite Chinese winter wheat investigated with SSR markers. Int. J. Mol. Sci. 7:e44510. doi: 10.1007/s11033-016-4066-z

タイトルに関連する用語 (6件)： 硬質 ,  冬コムギ ,  斑点病 ,  抵抗性 ,  ゲノム ,  研究