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J-GLOBAL ID：201902279630043906   整理番号：19A1406874

蛋白質-蛋白質界面上の非占有表面のターゲティング【JST・京大機械翻訳】

Targeting Unoccupied Surfaces on Protein-Protein Interfaces

著者 (7件)： Rooklin David (Department of Chemistry, New York University, New York, United States) ,  Modell Ashley E. (Department of Chemistry, New York University, New York, United States) ,  Li Haotian (Department of Chemistry, New York University, New York, United States) ,  Berdan Viktoriya (Department of Chemistry, New York University, New York, United States) ,  Arora Paramjit S. (Department of Chemistry, New York University, New York, United States) ,  Zhang Yingkai (Department of Chemistry, New York University, New York, United States) ,  Zhang Yingkai (NYU-ECNU Center for Computational Chemistry, New York University-Shanghai, China)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 139  号： 44  ページ： 15560-15563  発行年： 2017年11月08日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質-蛋白質界面を標的とするペプチド模倣足場の使用は,阻害剤設計のための有望な戦略である。この戦略は,天然のホットスポット残基の濃度を示す蛋白質モチーフの模倣に依存する。この制約を扱うために,著者らは,標的と非占有の両方であるペプチド模倣モチーフ近くの高品質ポケットを同定するために,AlphaSpaceによってガイドされたポケット中心計算設計戦略を提示した。Alphaクラスタはポケット空間の空間表現として機能し,界面を横切るポケット占有を最適化する阻害剤を設計するための天然及び非天然アミノ酸突然変異の選択を誘導するために用いられる。完全長野生型MLL配列に対抗するためMLL内の単一螺旋モチーフを最適化することにより,挑戦的蛋白質-蛋白質相互作用標的KIX/MLLに対する戦略を試験した。分子動力学シミュレーションと実験的蛍光偏光分析を用いて,最適化ペプチド配列の有効性を検証した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 有効性 ,  クラスタ ,  最適化 ,  計算機シミュレーション ,  ホットスポット ,  野生型 ,  蛍光 ,  ペプチド ,  *界面 ,  アミノ酸配列 ,  *タンパク質 ,  *ターゲティング ,  突然変異
準シソーラス用語： 非天然アミノ酸 ,  残基 ,  阻害剤 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (3件)： 蛋白質 ,  界面 ,  ターゲティング