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J-GLOBAL ID：201902280356070797   整理番号：19A1423902

Phyllostachys(イネ科,Bambusoideae)の系統発生に対する核遺伝子座と対立遺伝子変異の利用【JST・京大機械翻訳】

Using nuclear loci and allelic variation to disentangle the phylogeny of Phyllostachys (Poaceae, Bambusoideae)

著者 (7件)： Zhang Li-Na (Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, Yunnan 650201, China) ,  Zhang Li-Na (College of Life Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350002, China) ,  Ma Peng-Fei (Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, Yunnan 650201, China) ,  Zhang Yu-Xiao (Yunnan Academy of Biodiversity, Southwest Forestry University, Kunming, Yunnan 650224, China) ,  Zeng Chun-Xia (Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, Yunnan 650201, China) ,  Zhao Lei (Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, Yunnan 650201, China) ,  Li De-Zhu (Germplasm Bank of Wild Species, Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Kunming, Yunnan 650201, China)
資料名： Molecular Phylogenetics and Evolution  (Molecular Phylogenetics and Evolution)
巻： 137  ページ： 222-235  発行年： 2019年 
JST資料番号： W1678A  ISSN： 1055-7903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 配列決定技術の開発により,複数の核遺伝子の利用は,困難な系統発生を解決するために従来になった。しかしながら,この技術は,不完全な系統分類(ILS)と網状進化の結果として,遺伝子-樹木不一致による難問も示す。対立遺伝子は,生物の進化に関する情報を含む個体内の配列変化を示すことができるが,それらはランダムに位相化されたゲノム配列を用いてほとんど全ての系統発生分析で無視され続けている。ここでは,経済的に重要な竹属Phyllostachys(Poaceae,Bambusoideae)の系統発生を研究するために,複数の核遺伝子座から対立遺伝子を組み込むことを試みた。全部で3926の配列を得て,39の試料採取種から61の遺伝子に対する広範な対立遺伝子変異を報告した。選択された対立遺伝子から成るデータセットを用いて,異なる対立遺伝子から推論された系統発生的関係の間の実質的な不一致を示し,また,連結と石炭化の方法の間についても示した。さらに,ILSとハイブリダイゼーションは不一致系統発生シグナルの原因となることが示唆された。これらの可能性のある原因を考慮に入れて,我々はPhyllostachysとその2つの形態学的に定義されたセクションの単系統性を回復した。著者らの研究はまた,対立遺伝子が高度に支持されたが偽の系統発生をもたらすことができるので,対立遺伝子が系統発生研究においてより多くの注意を払うことを示唆している。一方,対立遺伝子は複雑な進化過程,特にハイブリダイゼーションを解明するのに役立つ。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *対立遺伝子 ,  *系統発生 ,  モルフォロジー ,  体系分類 ,  *マダケ属 ,  位相 ,  *イネ科
準シソーラス用語： 進化過程 ,  系統解析 ,  ゲノム配列 ,  *細胞核遺伝子 ,  *対立遺伝子変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 対立遺伝子 ,  竹 ,  ハイブリダイゼーション ,  不完全系統ソーティング ,  モノフィル ,  系統学的推論

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  動物分類学  (EJ01030T)

タイトルに関連する用語 (6件)： Phyllostachys ,  イネ科 ,  系統発生 ,  核 ,  遺伝子座 ,  対立遺伝子変異