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J-GLOBAL ID：201902281228568205   整理番号：19A1593994

インドのイヌビエとイヌビエのトランスクリプトームは乾燥適応と微量栄養素蓄積に関与する推定遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomes of Indian barnyard millet and barnyardgrass reveal putative genes involved in drought adaptation and micronutrient accumulation

著者 (9件)： Jayakodi Murukarthick (Department of Plant Science, Plant Genomics and Breeding Institute, Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Madheswaran Manimekalai (Department of Plant Breeding and Genetics, Agricultural College and Research Institute, Tamil Nadu Agricultural University, Madurai, Tamil Nadu, India) ,  Adhimoolam Karthikeyan (Department of Biotechnology, Agricultural College and Research Institute, Tamil Nadu Agricultural University, Madurai, Tamil Nadu, India) ,  Perumal Sampath (Agriculture and Agri-Food Canada, Saskatoon, SK, Canada) ,  Manickam Dhasarathan (Department of Biotechnology, Agricultural College and Research Institute, Tamil Nadu Agricultural University, Madurai, Tamil Nadu, India) ,  Kandasamy Thangaraj (Department of Plant Breeding and Genetics, Agricultural College and Research Institute, Tamil Nadu Agricultural University, Madurai, Tamil Nadu, India) ,  Yang Tae-Jin (Department of Plant Science, Plant Genomics and Breeding Institute, Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences, Seoul National University, Seoul, Republic of Korea) ,  Natesan Senthil (Department of Biotechnology, Agricultural College and Research Institute, Tamil Nadu Agricultural University, Madurai, Tamil Nadu, India) ,  Natesan Senthil (Department of Plant Molecular Biology and Bioinformatics, Centre for Plant Molecular Biology and Biotechnology, Tamil Nadu Agricultural University, Coimbatore, Tamil Nadu, India)
資料名： Acta Physiologiae Plantarum  (Acta Physiologiae Plantarum)
巻： 41  号： 5  ページ： 1-11  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3992A  ISSN： 1861-1664  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： インドのイヌビエ(Echinochloa frutentacea)は,食物繊維,ミネラルおよび蛋白質の豊富な供給源である。遺伝資源の欠如は,その栄養素蓄積と気候回復に関与する遺伝子の発見を遅らせている。ここでは,機能的に注釈されている90%以上のE.frumentacea[97065転写物,および31,789の長い非コードRNA(lncRNA)転写物]とその野生相対E.crus-galli(93,725転写物,68,480蛋白質コード転写物,89%を含む)の最初のトランスクリプトームを提示した。比較トランスクリプトーム解析により,E.crus-galliと比較したときに,アップレギュレーションまたはダウンレギュレーション発現のどちらかを示すインドのバーナビエにおける4159の蛋白質コード化および2258のlncRNA転写産物を同定し,インドのバーナビエに特有の3489の蛋白質コード転写物も検出した。更なる分析により,光合成がインドのバーナビエの干ばつ適応において重要である可能性があることを明らかにした。次に,干ばつ耐性とFeおよびZn蓄積に関与する可能な遺伝子調節を同定した。さらに,簡単な配列反復(SSR)含有配列に基づいて,30のSSRプライマー対を任意に選択し,合成し,30のE.frumentacea系統をスクリーニングするために使用した。これらのうち,10SSRプライマーは多形であった。まとめると,著者らの結果は,インドのバーナビエにおける微量栄養素蓄積と干ばつ耐性の知識,ならびにEchinochloa種の遺伝的多様性を強化する。Copyright 2019 Franciszek Gorski Institute of Plant Physiology, Polish Academy of Sciences, Krakow Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 干ばつ ,  無機質 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  耐干性 ,  亜鉛 ,  タンパク質 ,  *インド ,  *トランスクリプトーム ,  *遺伝子 ,  *栄養素
準シソーラス用語： ヒエ属 ,  非翻訳長鎖RNA ,  *微量栄養素 ,  *Echinochloa crus-galli , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 干ばつ ,  単純配列反復 ,  インドのイヌビエ ,  微量栄養素

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： インド ,  イヌビエ ,  トランスクリプトーム ,  適応 ,  微量栄養素 ,  蓄積 ,  推定 ,  遺伝子