文献

J-GLOBAL ID：201902281491052336   整理番号：19A2013198

階層的構造化事前を用いた骨肉腫TRIOデータのBayes遺伝子に基づくゲノムワイド関連研究分析【JST・京大機械翻訳】

A Bayesian Gene-Based Genome-Wide Association Study Analysis of Osteosarcoma Trio Data Using a Hierarchically Structured Prior

著者 (5件)： Yang Yi (Division of Biostatistics, University of Minnesota, Minneapolis, MN, USA) ,  Basu Saonli (Division of Biostatistics, University of Minnesota, Minneapolis, MN, USA) ,  Mirabello Lisa (Division of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA) ,  Spector Logan (Division of Pediatric Epidemiology and Clinical Research, Department of Pediatrics and Masonic Cancer Center, University of Minnesota, Minneapolis, MN, USA) ,  Zhang Lin (Division of Biostatistics, University of Minnesota, Minneapolis, MN, USA)
資料名： Cancer Informatics  (Cancer Informatics)
巻： 17  ページ： 1176935118775103  発行年： 2018年 
JST資料番号： W5157A  ISSN： 1176-9351  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 骨肉腫は,小児と若年成人の間で最も一般的な原発性悪性骨癌であると考えられている。これまでの研究は,骨肉腫に対するリスク因子として成長スパートと高さを示唆している。しかしながら,遺伝的原因に関する研究は,疾患のまれな発生を与えられている。本研究では,209名の患者とそれらの影響を受けない両親から構成され,骨肉腫に対する遺伝的リスク因子を同定するためにゲノムワイド関連研究(GWAS)を実施した家族トリオデータセットにおいて研究した。著者らは,SNP-遺伝子階層構造を組み込んだ階層的に構造化された事前を用いる,トリオデータの尤度比検定から得られた単一ヌクレオチド多型(SNP)レベル要約統計に基づいて,Bayes遺伝子ベースGWASを実行した。Bayesアプローチは,テスト数の減少によりSNPレベルGWAS分析よりも高いパワーを有し,SNP間の相関を考慮することによりロバストであり,遺伝子内のSNPを介して情報を借列する。ゲノム全体の有意性を達成した217の遺伝子を同定した。遺伝子セットの不正確な経路分析は,骨肉腫が破骨細胞におけるTP53,エストロゲン受容体シグナル伝達,生体異物代謝シグナル伝達,およびRANKシグナル伝達に潜在的に関連することを示した。Copyright The Author(s) 2018 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノムワイド関連解析 ,  階層構造 ,  *遺伝子 ,  *遺伝 ,  破骨細胞 ,  エストロゲン受容体 ,  *骨肉腫 ,  危険因子 ,  ロバスト性 ,  子供 ,  *ゲノム ,  一塩基多型 ,  ヒト
準シソーラス用語： TP53 ,  両親 ,  若年成人 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Bayes HSVS ,  融合LASSO ,  遺伝子に基づくGWAS ,  多重試験 ,  TRIOデータ

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： 構造化 ,  骨肉腫 ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  研究 ,  分析