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J-GLOBAL ID:201902282049533170   整理番号:19A2256569

陸地ワタの低世代集団繊維品質QTLマッピング及び候補遺伝子機能注釈【JST・京大機械翻訳】

QTL Mapping of Fiber Quality in Low-Generation Upland Cotton Populations and Functional Annotation of Candidate Genes
著者 (8件):
資料名:
巻: 31  号:ページ: 282-296  発行年: 2019年 
JST資料番号: C2409A  ISSN: 1002-7807  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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[目的]繊維品質の量的形質遺伝子座(Quantitativetraitloci,QTLs)の定位及びその遺伝子の機能アノテーションを通じて、分子マーカーの補助育種に理論的根拠を提供する。[方法]2つの繊維品質に差異のある陸地ワタ品種(系統)中綿の49と396289を親としてF2群体を構築し、高密度遺伝地図を基礎とし、3つの環境のFz3家系に細度と成熟度を含む7つの繊維品質形質QTLsの定位を行った。オルソログ遺伝子クラスター(Clustersoforthologousgroups,COG),遺伝子オントロジー(Geneontology)を利用した。GO)と京都遺伝子とゲノム百科全書(Kyotoencyclopediaofgenesandgenomes,KEGG)などのデータベースはQTLsに対して遺伝子機能注釈を行った。[結果]157の繊維品質に関連するQTLsが得られ、20本の染色体に分布し、A03、A04、D02、A11とD07など多くの性状を持つQTLsが凝集し、繊維品質形質を制御する重要な染色体である可能性がある。全部で13の安定QTLsが得られ、そのうちqFL-A03-1とqFin-A11-4は3つの環境の中で重複して出現し、他の9つのQTLsは2つの環境で重複して現れた。COG、GOとKEGGによるQTLsに対する遺伝子機能注釈を行い、合計4763の候補遺伝子を得て、3つのデータベースはそれぞれ2416、4188と2512の遺伝子を注釈し、安定QTLsに429の遺伝子を注釈した。いくつかの遺伝子は繊維品質と密接に関係する可能性がある。[結論]ハイスループットシークエンシングで得られた高密度遺伝地図は、多くのQTLsを獲得し、繊維品質関連候補遺伝子の選別及び性状の改良に役立ち、育種効率を高めることができる。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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繊維料作物 

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