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J-GLOBAL ID：201902282151875456   整理番号：19A1806282

細菌における第二グアニジンリボスイッチクラスの生化学的検証【JST・京大機械翻訳】

Biochemical Validation of a Second Guanidine Riboswitch Class in Bacteria

著者 (5件)： Sherlock Madeline E. (Department of Molecular Biophysics and Biochemistry, Yale University) ,  Malkowski Sarah N. (Department of Chemistry, Yale University) ,  Breaker Ronald R. (Department of Molecular Biophysics and Biochemistry, Yale University) ,  Breaker Ronald R. (Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology, Yale University) ,  Breaker Ronald R. (Howard Hughes Medical Institute, Yale University)
資料名： Biochemistry  (Biochemistry)
巻： 56  号： 2  ページ： 352-358  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0270B  ISSN： 0006-2960  CODEN： BICHAW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近,ykkCとykkC-IIIと呼ばれるリボスイッチ候補の代表者が遊離グアニジンと直接結合することが決定された。グアニジン結合ykkCモチーフRNAは,現在,グアニジン-Iリボスイッチをコードする遺伝子の発現を一般的に調節することが示されており,他は,EmrEおよびSugEのようなグアニジン排出蛋白質をコードする他の遺伝子の発現を調節していることが示されている。同様に,類似の排出蛋白質をコードする遺伝子は,現在,再生されたグアニジン-IIIリボスイッチであるykkC-IIIモチーフRNAと関連している。これらの新たに確立されたリボスイッチクラスのリガンドとしてのグアニジンの検証の前に,他のRNAモチーフは比較ゲノム解析により発見され,その小さなサイズと元のykkCモチーフのそれらと類似した遺伝子会合のためミニykkCと命名された。これらの異なるRNA構造は同じリガンドに応答すると仮定した。しかし,ミニykkC RNAの小さいサイズと反復的性質は,それが蛋白質因子の作用を介してリガンドに応答する可能性があることを示唆した。ここでは,その非常に単純な構造にもかかわらず,ミニykkCモチーフRNAがグアニジン-IIリボスイッチと呼ばれる異なるクラスのグアニジン感知RNAを構成することを示した。驚くべきことに,ミニykkCモチーフを構成する2つの幹-ループ構造の各々は,協調的に遊離グアニジンと直接結合するように見える。これらの知見は,細菌がこの化合物の毒性効果を克服するために多様なグアニジン応答性リボスイッチを広範囲に利用することを明らかにした。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生化学 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  *細菌 ,  毒性 ,  応答特性 ,  RNA【核酸】 ,  ループ構造
準シソーラス用語： RNA構造 ,  比較ゲノミクス ,  EmrE蛋白質 ,  *リボスイッチ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (1件)： グアニジン

タイトルに関連する用語 (3件)： 細菌 ,  生化学 ,  検証