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J-GLOBAL ID：201902282403654378   整理番号：19A2583324

結腸直腸癌組織発現プロファイリングチップのバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Microarrays-based bioinformatics analysis of gene expression profile of colorectal cancer tissue

著者 (3件)： He Jia (武漢市第八医院 痔二科 湖北武漢 430010) ,  Guan Zhongan (山東中医薬大学附属医院 肛腸科 山東 済南 250014) ,  Pan Li (武漢市第八医院 痔二科 湖北武漢 430010)
資料名： Zhongguo Xiandai Putong Waikejinzhan  (Zhongguo Xiandai Putong Waikejinzhan)
巻： 22  号： 7  ページ： 510-514  発行年： 2019年 
JST資料番号： C3346A  ISSN： 1009-9905  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:結腸直腸癌の発生発展の分子機構を探求し、結腸直腸癌の早期診断及び予後のバイオマーカーを探す。方法;GEOデータベースから結腸直腸癌発現スペクトルチップを選択し、R言語中のlimma関数を用いて差異発現分析を行い、差次的発現遺伝子を獲得し、DAVID6.7を用いて差次的発現遺伝子をKEGG信号経路分析を行う。GEPIAオンラインツールを用いて,TCGA-COADサンプルにおける差次的遺伝子の発現を調べ,Kaplan-Meier生存曲線(OS)を描いた。結果;3つの発現スペクトルチップの差次的発現分析結果では、148個の同じ遺伝子があり、これらの遺伝子は結腸直腸癌の発生発展と密接な関係があり、KEGGシグナル伝達経路の分析により、結腸直腸癌組織は正常組織より窒素代謝、・・・アルドステロンによるナトリウム再吸収の調節などの信号経路は著しい変化があり、GEPIAのオンラインツール分析はSLC04A1、FAP、SULF1、COL1A1の4つの遺伝子はTCGA-COADですべて高発現を示し、SLC04A1、FAP、P.SULF1、COL1A1がそれぞれ高発現する結腸癌患者の生存期間は低発現の結腸癌患者より明らかに短縮した。結論:窒素代謝、アルドステロン調節ナトリウム再吸収などのシグナル伝達経路の変化は結腸直腸癌の発生発展の重要な分子機序であり、SLC04A1、FAP、SULF1、COL1A1などの遺伝子は結腸直腸癌患者の予後評価のマーカーとして用いることができる。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ナトリウム ,  結腸腫瘍 ,  予後 ,  *遺伝子 ,  発癌 ,  ヒト ,  データベース ,  バイオマーカー ,  アルデヒド ,  ステロイド ,  エノン ,  脂環式アルコール ,  脂環式ケトン ,  ジオール ,  ジケトン ,  ヒドロキシケトン
準シソーラス用語： 再吸収 ,  伝達経路 ,  差次的遺伝子発現 ,  Rパッケージ ,  *結腸直腸 ,  *バイオインフォマティクス ,  *結腸直腸癌 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

物質索引 (1件)： アルドステロン

タイトルに関連する用語 (5件)： 結腸直腸癌 ,  組織発現 ,  プロファイリング ,  バイオインフォマティクス ,  分析