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J-GLOBAL ID：201902282771802244   整理番号：19A2301820

異なる設計の3次元活動景観モデルとその化合物マッピングと効力予測への応用【JST・京大機械翻訳】

Three-Dimensional Activity Landscape Models of Different Design and Their Application to Compound Mapping and Potency Prediction

著者 (4件)： Miyao Tomoyuki (Data Science Center and Graduate School of Science and Technology, Nara Institute of Science and Technology, Nara, Japan) ,  Funatsu Kimito (Data Science Center and Graduate School of Science and Technology, Nara Institute of Science and Technology, Nara, Japan) ,  Funatsu Kimito (Department of Chemical System Engineering, School of Engineering, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Bajorath Juergen (Department of Life Science Informatics, B-IT, LIMES Program Unit Chemical Biology and Medicinal Chemistry, Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universitaet, Germany)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 59  号： 3  ページ： 993-1004  発行年： 2019年 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 活性景観(ALs)は,活性化合物の構造的および効力データを統合し,化合物データセットに含まれる構造活性相関(SARs)への図式アクセスを提供する。三次元(3D)ALsは,第三次元として追加された補間活性表面を持つ化学空間の二次元(2D)射影として概念化できる。このような3D ALsは特にSAR可視化に直感的である。本研究では,異なる投影法と指紋記述子に基づいて3D ALsを生成し,それらのトポロジーを比較した。さらに,定性分析を超えて,半定量的および定量的能力予測のための3D ALsの使用を研究した。多次元スケーリングのニューラルネットワーク変種であるニューロスケールを,Gauss過程回帰(GPR)と組み合わせて,訓練化合物を説明する3D ALsを生成するための好ましいアプローチとして,高精度でそれらのSAR特性を同定した。一方,GPRによって誘発された過剰適合は,適用された投影法にかかわらず,一般的に,効力値予測の精度を制限した。しかしながら,3D ALsは,対応するAL領域に対する種々の効力レベルを有する試験化合物の信頼できるマッピングを可能にした。最も正確なマッピングは神経スケールモデルで達成された。まとめると,著者らの分析の結果は,グラフィックSAR探査のための3D ALsの高い可能性と強力な試験化合物の同定を示す。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 内挿法 ,  二次元 ,  可視化 ,  *モデル ,  *予測 ,  位相幾何学 ,  *三次元 ,  高次元 ,  ニューラルネットワーク ,  射影 ,  指紋 ,  神経
準シソーラス用語： 値予測 ,  概念形成 ,  情報へのアクセス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  ドキュメンテーション  (GU01030C)

タイトルに関連する用語 (8件)： 設計 ,  3次元 ,  活動 ,  景観 ,  モデル ,  マッピング ,  予測 ,  応用