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J-GLOBAL ID：201902283214085073   整理番号：19A0660040

QM/MMメタ動力学により明らかにされたアデノシルラジカル誘発DNA損傷の優性経路【JST・京大機械翻訳】

Dominant Pathways of Adenosyl Radical-Induced DNA Damage Revealed by QM/MM Metadynamics

著者 (6件)： Wityk Pawel (Faculty of Chemistry, University of Gdansk, Poland) ,  Wieczor Milosz (Department of Physical Chemistry, Faculty of Chemistry, Gdansk University of Technology, Poland) ,  Makurat Samanta (Faculty of Chemistry, University of Gdansk, Poland) ,  Chomicz-Manka Lidia (Faculty of Chemistry, University of Gdansk, Poland) ,  Czub Jacek (Department of Physical Chemistry, Faculty of Chemistry, Gdansk University of Technology, Poland) ,  Rak Janusz (Faculty of Chemistry, University of Gdansk, Poland)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 12  ページ： 6415-6423  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 臭素化核酸塩基は二本鎖DNAを水和電子に感作し,放射線療法中に低酸素癌細胞で産生される主要な遺伝毒性種の一つである。したがって,そのような放射線増感剤は,隣接組織を保護しながら,固形腫瘍内の治療効率を高めるために局所的に投与することができる。溶媒和電子が8-ブロモアデノシンに付着すると,潜在的な増感剤,臭化物の解離はDNA損傷の範囲を生成することが知られている反応性C8アデノシルラジカルをもたらす。本研究では,この不安定なラジカルがゲノムDNAのさらなる損傷を引き起こす機構を解明するためのマルチスケール計算アプローチを提案した。古典的な分子動力学的配座サンプリングとQM/MMメタ動力学の組み合わせを用いて,現実的なモデルにおける妥当な反応経路の熱力学と動力学を研究し,重要な過程の異なる時間スケールを橋渡しし,DNAの空間的制約を説明した。得られたデータは,ラジカル種の有効寿命に依存するそれらの比率と収率により,実験的設定-シクロプリンとβ-脱離(一本鎖切断)損傷において主に観察される生成物を正確に予測する速度論モデルを構築することを可能にした。今日まで,著者らの研究は,二本鎖DNAにおけるプリンラジカル反応性の最も完全な記述を提供し,分子詳細における求電子プリンの放射線増感作用を説明し,生体分子における競合反応経路の計算モデリングのための概念的枠組みを提供した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *DNA損傷 ,  脱着 ,  モデル ,  感作 ,  *DNA【核酸】 ,  増感剤 ,  計算 ,  分子動力学 ,  ラジカル反応 ,  速度論 ,  *ラジカル ,  立体配座 ,  反応経路 ,  腫瘍細胞 ,  窒素複素環化合物

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (1件)： プリン

タイトルに関連する用語 (5件)： 動力学 ,  誘発 ,  DNA損傷 ,  優性 ,  経路