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J-GLOBAL ID：201902283293114571   整理番号：19A2729468

Ajowan(Trachyspermum ammi L.)花序のトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome analysis of Ajowan (Trachyspermum ammi L.) inflorescence

著者 (5件)： Amiripour Mahboubeh (Department of Agronomy and Plant Breeding Sciences, College of Abouraihan, University of Tehran, Tehran, Iran) ,  Sadat Noori Seyed Ahmad (Department of Agronomy and Plant Breeding Sciences, College of Abouraihan, University of Tehran, Tehran, Iran) ,  Shariati Vahid (Department of Plant Biotechnology, National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology, Tehran, Iran) ,  Soltani Howyzeh Mehdi (Department of Agronomy and Plant Breeding Sciences, College of Abouraihan, University of Tehran, Tehran, Iran) ,  Soltani Howyzeh Mehdi (Department of Genetics and Plant Breeding, Ahvaz Branch, Islamic Azad University, Ahvaz, Iran)
資料名： Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology  (Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology)
巻： 28  号： 4  ページ： 496-508  発行年： 2019年 
JST資料番号： W4648A  ISSN： 0971-7811  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Trachyspermum AMMI(L.) Springは,一般的に「Ajowan」として知られており,ファミリー「Apiaceae」に属している。Ajowan果実は2~6%の精油を産出し,チモールは油の主成分(35~60%)である。T.ammiは高い薬用価値がある;しかし,この薬用植物のゲノム資源はまれである。ajowan花序の転写配列を得るために,RNA-SeqをIllina HiSeq2000プラットフォームを用いて適用した。de novo集合に続いて,68051の単一遺伝子が生産され,そのうち43156の単一遺伝子が異なる配列データベースに対して注釈された。ajowan単遺伝子のBLASTX結果は,41950および29273の単一遺伝子が,それぞれNCBI非冗長(Nr)蛋白質およびUniProtデータベースにおいてヒットされていることを示した。遺伝子オントロジー(GO)分類により,29258の単一遺伝子が55のGO用語に分類され,26002の単一遺伝子がOrthorousグループカテゴリーにクラスタ化されていることを示した。GenesとGenomes(KEGG)経路データベースの京都エンシクロペジアに対するBLASTXの結果は,14986の単一遺伝子が127の経路で代表されることを示した。加えて,単純配列反復(SSR)と1180の推定転写因子遺伝子を含む8751の配列も同定された。著者らが知る限り,ゲノム情報のこのリポジトリは,現在,トランスクリプトーム特性化,遺伝子発見,SSR分子マーカーの開発,およびajowanに関する将来のゲノム研究に利用可能な最初の資源である。Copyright 2019 Society for Plant Biochemistry and Biotechnology Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  データベース ,  *花序 ,  薬用植物 ,  京都府 ,  リポジトリ ,  クラスタ化 ,  ゲノム ,  キャラクタリゼーション ,  *トランスクリプトーム ,  RNA【核酸】 ,  フェノール類
準シソーラス用語： 遺伝子オントロジー ,  *Trachyspermum ,  *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： RNA-seq ,  アジョワン ,  テルペノイド生合成 ,  転写因子 ,  単純配列反復

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： チモール

タイトルに関連する用語 (3件)： Ammi ,  花序 ,  トランスクリプトーム解析