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J-GLOBAL ID：201902283658770635   整理番号：19A2398948

相互作用分子によるDNAの標的探索:第一通過アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Target search on DNA by interacting molecules: First-passage approach

著者 (2件)： Shin Jaeoh (Department of Chemistry, Rice University, Houston, Texas 77005, USA) ,  Kolomeisky Anatoly B. (Department of Chemistry, Rice University, Houston, Texas 77005, USA)
資料名： Journal of Chemical Physics  (Journal of Chemical Physics)
巻： 151  号： 12  ページ： 125101-125101-7  発行年： 2019年 
JST資料番号： C0275A  ISSN： 0021-9606  CODEN： JCPSA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子調節は生細胞における最も重要な基本的生物学的過程の1つである。それはDNA上に特異的部位を位置する複数の蛋白質分子を含み,遺伝子開始または遺伝子抑制多分子複合体を組み立てる。DNA標的に対する蛋白質探索動力学は集中的に研究されているが,遺伝的活性化または抑制中の分子間相互作用の役割は十分に定量化されていない。ここでは,探索過程に関与する二量体分子複合体を可逆的に形成できる2つの相互作用分子に対する標的探索の簡単な一次元モデルを提示した。さらに,蛋白質は特定の標的部位において有限の滞留時間を有し,両蛋白質が標的に同時に存在すると遺伝子は活性化されるか抑制される。このモデルを,第一通過解析計算とモンテカルロ計算機シミュレーションを用いて解析した。探索動力学は分子間相互作用の強さと標的滞留時間に依存して複雑な挙動を示すことを示した。また,探索時間は分子錯体の解離速度の関数として非単調挙動を示すことが分かった。これらの観測を説明する物理化学的議論を示した。著者らの理論的アプローチは,複数の転写因子蛋白質による遺伝子活性化/抑制の複雑な過程における分子相互作用の重要性を強調する。Copyright 2019 AIP Publishing LLC All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： モデル ,  分子間相互作用 ,  *相互作用 ,  二量体 ,  タンパク質 ,  滞留時間 ,  遺伝子 ,  *DNA【核酸】 ,  分子複合材料 ,  計算機シミュレーション ,  モンテカルロ法 ,  一次元 ,  遺伝 ,  転写因子
準シソーラス用語： 生細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 相互作用 ,  分子 ,  DNA ,  標的 ,  探索