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J-GLOBAL ID：201902283751349254   整理番号：19A2468059

16SrおよびGroELに基づくTaqmanプローブを用いたリアルタイムPCRアッセイによるヤシの致死的黄化ファイトプラズマ(グループ16SrIV)の同時検出【JST・京大機械翻訳】

Simultaneous detection of coconut lethal yellowing phytoplasmas (group 16SrIV) by real-time PCR assays using 16Sr- and GroEL-based TaqMan probes

著者 (7件)： Cordova Ivan (Centro de Investigacion Cientifica de Yucatan, Biotechnology Unit, Merida, Yucatan, Mexico) ,  Oropeza Carlos (Centro de Investigacion Cientifica de Yucatan, Biotechnology Unit, Merida, Yucatan, Mexico) ,  Harrison Nigel (Plant Pathology Department, Fort Lauderdale Research and Education Center, University of Florida, Fort Lauderdale, FL, USA) ,  Ku-Rodriguez Sandra (Centro de Investigacion Cientifica de Yucatan, Biotechnology Unit, Merida, Yucatan, Mexico) ,  Puch-Hau Carlos (Centro de Investigacion Cientifica de Yucatan, Biotechnology Unit, Merida, Yucatan, Mexico) ,  Narvaez Maria (Centro de Investigacion Cientifica de Yucatan, Biotechnology Unit, Merida, Yucatan, Mexico) ,  Saenz Luis (Centro de Investigacion Cientifica de Yucatan, Biotechnology Unit, Merida, Yucatan, Mexico)
資料名： Journal of Plant Pathology  (Journal of Plant Pathology)
巻： 101  号： 3  ページ： 609-619  発行年： 2019年 
JST資料番号： W4649A  ISSN： 2239-7264  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 致死的黄変(LY)はメキシコ,中央アメリカ及びカリブ海島におけるヤシに対する重大な脅威である。それはグループ16SrIVのファイトプラズマによって引き起こされ,特にサブグループ-Aと-Dはメキシコ南東部で成長したヤシヤシに影響を及ぼす主要なファイトプラズマであった。したがって,診断目的だけでなく,病原体-植物-ベクター病原系の理解を改善するために,植物プラズマの16SrIV群を確実に検出することが重要である。16Sリボソームオペロン遺伝子は,普遍的なファイトプラズマ検出のためのプローブとプライマーの標的として特に使用されている。しかしながら,その保存的性質は,フィトプラズマのより微細な特性化と分化を支持するために非リボソーム遺伝子の探索を課し,特に密接に関連し,1つの代替物はサブグループ16SrIV-Aと16SrIV-Dの特異的検出のためのGroEL遺伝子であった。GroEL遺伝子と16S rRNAの両方を標的とするリアルタイムPCR(TaqMan)に基づいて,高感度,迅速かつ信頼性のあるシングルプレックスおよび二重アッセイを開発した。LY症状を持つpalmsから得られたDNA抽出物を分析するとき,従来のネステッドPCRと比較して高感度で分析が行われた。LY 16S TaqManプローブ分析は両サブグループからDNAを増幅したが,LY GroEL TaqManプローブ分析はサブグループ16SrIV-AからDNAを増幅した。二重TaqManプローブ分析は,メキシコにおけるパルムスに主に影響を及ぼすフィトプラズマである16Srサブグループ-Aと-DのLYファイトプラズマの同時検出と定量のための新しいオプションである。Copyright 2019 Societa Italiana di Patologia Vegetale (S.I.Pa.V.) Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ベクター ,  診断 ,  キャラクタリゼーション ,  *黄化 ,  *プラズマ ,  遺伝子 ,  メキシコ合衆国 ,  *リアルタイムPCR法 ,  病原体 ,  DNA【核酸】 ,  *プローブ
準シソーラス用語： DNA抽出 ,  *同時検出 ,  *Phytoplasma ,  *GroEL蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Cocos nucifera L. ,  PALM ,  診断 ,  シングルプレックスおよび二重アッセイ

分類 (1件)： 細菌による植物病害  (FC04053P)

タイトルに関連する用語 (9件)： GroEL ,  プローブ ,  リアルタイムPCR ,  アッセイ ,  ヤシ ,  黄化 ,  ファイトプラズマ ,  グループ ,  同時検出