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J-GLOBAL ID：201902284170049758   整理番号：19A0405387

LC-MSに基づくメタボロミクスのための代謝産物アノテーションの挑戦,進歩および約束【JST・京大機械翻訳】

Challenges, progress and promises of metabolite annotation for LC-MS-based metabolomics

著者 (8件)： Chaleckis Romanas (Gunma University Initiative for Advanced Research (GIAR), Gunma University, Gunma, Japan) ,  Chaleckis Romanas (Division of Physiological Chemistry II, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Meister Isabel (Gunma University Initiative for Advanced Research (GIAR), Gunma University, Gunma, Japan) ,  Meister Isabel (Division of Physiological Chemistry II, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Zhang Pei (Gunma University Initiative for Advanced Research (GIAR), Gunma University, Gunma, Japan) ,  Zhang Pei (Division of Physiological Chemistry II, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Wheelock Craig E (Gunma University Initiative for Advanced Research (GIAR), Gunma University, Gunma, Japan) ,  Wheelock Craig E (Division of Physiological Chemistry II, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden)
資料名： Current Opinion in Biotechnology  (Current Opinion in Biotechnology)
巻： 55  ページ： 44-50  発行年： 2019年 
JST資料番号： W0243A  ISSN： 0958-1669  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 正確なアノテーションはデータ解釈のために重要である。しかしながら,代謝産物同定は,非標的化メタボロミクスにおける主要なボトルネックである。代謝産物同定のためのコミュニティガイドラインは10年前に公表されているが,推奨基準の適応は限られている。種々のクロマトグラフィーと質量分析取得法の組み合わせによるLC-MSデータの複雑さは,しばしば非標準化手動のカーレーションを含む多様なワークフローの出現をもたらした。ここでは,代謝産物報告に含まれるパラメータをレビューし,報告された代謝産物アノテーションにおける信頼レベルを推定するためのワークフローを提供する。代謝産物同定の将来は,メタボロームデータリポジトリと関連データ解析ツールの使用に基づいている。これは,データを共有し,再分析し,自動化された方法で再注釈することを可能にする。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 標準化 ,  コミュニティ ,  リポジトリ ,  自動化 ,  *アノテーション ,  クロマトグラフィー ,  ワークフロー ,  質量分析 ,  *代謝産物 ,  *LC-MS分析 ,  ターゲティング ,  メタボローム ,  *メタボロミクス ,  改変
準シソーラス用語： 解析ツール ,  データ解釈 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 液体クロマトグラフィー  (CC04014L) ,  質量分析  (CC03013N)

タイトルに関連する用語 (4件)： LC-MS ,  メタボロミクス ,  代謝産物 ,  アノテーション