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J-GLOBAL ID：201902284517603170   整理番号：19A1528037

中国南西部のHPV-33/HPV-58E6とE7における変異体と治療エピトープの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of variants and therapeutic epitopes in HPV-33/HPV-58 E6 and E7 in Southwest China

著者 (17件)： He Jiaoyu (Key Laboratory of Bio-Resource and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, People’s Republic of China) ,  He Jiaoyu (Bio-resource Research and Utilization Joint Key Laboratory of Sichuan and Chongqing, Chongqing, People’s Republic of China) ,  He Jiaoyu (Chongqing Innovation Academy of Characteristic Bioindustry Technology, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Yang Yasi (Key Laboratory of Bio-Resource and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, People’s Republic of China) ,  Yang Yasi (Bio-resource Research and Utilization Joint Key Laboratory of Sichuan and Chongqing, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Yang Yasi (Chongqing Innovation Academy of Characteristic Bioindustry Technology, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Chen Zuyi (Key Laboratory of Bio-Resource and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, People’s Republic of China) ,  Chen Zuyi (Bio-resource Research and Utilization Joint Key Laboratory of Sichuan and Chongqing, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Chen Zuyi (Chongqing Innovation Academy of Characteristic Bioindustry Technology, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Liu Yang (Center of Growth, Metabolism and Aging, Key Laboratory of Bio-Resource and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, People’s Republic of China) ,  Bao Shanfei (Key Laboratory of Bio-Resource and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, People’s Republic of China) ,  Bao Shanfei (Bio-resource Research and Utilization Joint Key Laboratory of Sichuan and Chongqing, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Bao Shanfei (Chongqing Innovation Academy of Characteristic Bioindustry Technology, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Zhao Yun (Key Laboratory of Bio-Resource and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, People’s Republic of China) ,  Ding Xianping (Key Laboratory of Bio-Resource and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, People’s Republic of China) ,  Ding Xianping (Bio-resource Research and Utilization Joint Key Laboratory of Sichuan and Chongqing, Chongqing, People’s Republic of China) ,  Ding Xianping (Chongqing Innovation Academy of Characteristic Bioindustry Technology, Chongqing, People’s Republic of China)
資料名： Virology Journal (Web)  (Virology Journal (Web))
巻： 16  号： 1  ページ： 72  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7347A  ISSN： 1743-422X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトパピローマウイルス(HPV)E6およびE7癌蛋白質は,子宮頸癌のようなHPV関連疾患において重要な役割を果たし,治療ワクチンの理想的標的として使用できる。ヒト白血球抗原(HLA)は,HPV感染とその標的/認識機能による侵入を阻止する免疫反応に関与する。HPV-33とHPV-58は中国人女性の間で非常に一般的である。したがって,中国南西部におけるHPV-33およびHPV-58のE6およびE7領域特異的遺伝子多型を研究し,ワクチン設計のための理想的エピトープを同定することは非常に重要である。HPV-33とHPV-58の両方は,α-9属HPVに属し,高度に相同性があるので,それらの相関は著者らの研究に含まれる。中国南西部におけるHPV-33とHPV-58のE6とE7変異と多型性を研究するために,著者らはサンプルを採取して,抽出して配列決定したDNAを収集して,変異体を同定した。ヌクレオチド配列をMega6.0ソフトウェアによりアミノ酸に翻訳した。蛋白質配列の物理的/化学的性質,アミノ酸保存配列,および二次構造を,Protparamサーバ,ConSurfサーバ,およびPSIPREDソフトウェアによって分析した。HPV-33およびHPV-58におけるE6/E7参照および変異体配列のTおよびB細胞エピトープは,免疫Epitopeデータベース(IEDB)分析サーバおよびABCpredサーバによりそれぞれ予測された。5および7つの最適HLA-I制限T細胞エピトープをそれぞれHPV-33およびHPV-58E6から選択し,これらの最適エピトープはHPV-33E6の41-58EVYDFAFADLTVYREGNおよびHPV-58E6の40-60SEVYDFVADLRIVYRDGNPFに主に位置していた。6つの最適HLA-I制限T細胞エピトープはHPV-33とHPV-58E7から選択され,これらのエピトープはHPV-33E7の77-90RTIQQLLMGTVNIVとHPV-58E7の78-91RTLQQLLMGTIVに主に位置していた。HPV-33/HPV-58E6/E7遺伝子多型およびそれらの参照および変異体配列のT/B細胞エピトープを研究し,候補エピトープを中国南西部の人々に対する治療ワクチン設計のためのバイオインフォマティクス技術により選択した。本研究は,HPV-33とHPV-58の間のエピトープの相関を調べる最初のものであった。実験的検証の後,これらの選択されたエピトープは,不均一HLA集団において広範囲の免疫応答を誘導するために使用されるであろう。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *治療法 ,  DNA【核酸】 ,  *変異 ,  二次構造 ,  ワクチン ,  ヌクレオチド配列 ,  *エピトープ ,  予測 ,  ヒト ,  免疫反応 ,  遺伝子 ,  アミノ酸 ,  ソフトウェア ,  遺伝子多型 ,  子宮頚部腫瘍
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： ヒトパピローマウイルス ,  子宮頚癌 ,  HPV-33 ,  HPV-58 ,  E6 ,  E7 ,  ヒト白血球抗原 ,  エピトープ予測 ,  バイオインフォマティクス ,  中国南西部

分類 (2件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (32件)：

• Anticancer Res; A clinically relevant, syngeneic model of spontaneous, highly metastatic B16 mouse melanoma; V Bobek, K Kolostova, D Pinterova, G Kacprzak, J Adamiak, J Kolodziej; 30; 2010; 4799-4804; citation_id=CR1
• Cancer Res; A population-based prospective study of carcinogenic human papillomavirus variant lineages, viral persistence, and cervical neoplasia; M Schiffman, AC Rodriguez, Z Chen, S Wacholder, R Herrero, A Hildesheim; 70; 2010; 3159-3169; 10.1158/0008-5472.CAN-09-4179; citation_id=CR2
• New Engl J Med.; Epidemiologic classification of Human Papillomavirus types associated with cervical Cancer; N Munoz, FX Bosch, S Sanjose, R Herrero, X Castellsague, KV Shah; 348; 2003; 518-27; 10.1056/NEJMoa021641; citation_id=CR3
• Br J Cancer; Human papillomavirus infection in Beijing, People’s republic of China: a population-based study; R Zhao, WY Zhang, MH Wu, SW Zhang, J Pan, L Zhu; 101; 2009; 1635-1640; 10.1038/sj.bjc.6605351; citation_id=CR4
• N Engl J Med; Epidemiologic classification of human Papillomavirus types associated with cervical Cancer; N Muñoz, FX Bosch, S Sanjosé, R Herrero, X Castellsagué, KV Shah; 348; 2003; 518-527; 10.1056/NEJMoa021641; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： 中国 ,  HPV ,  変異体 ,  治療 ,  エピトープ ,  同定