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J-GLOBAL ID：201902284758239930   整理番号：19A2910347

ゲノム分解ウイルスおよび細胞メタゲノムは深い淡水湖における潜在的な重要なウイルス-宿主相互作用を明らかにした【JST・京大機械翻訳】

Genome-resolved viral and cellular metagenomes revealed potential key virus-host interactions in a deep freshwater lake

著者 (8件)： Okazaki Yusuke (Center for Ecological Research, Kyoto University, 2-509-3 Hirano, Otsu, Shiga, 520-2113, Japan) ,  Okazaki Yusuke (Bioproduction Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Central 6, Higashi 1-1-1, Tsukuba, Ibaraki 305-8566, Japan) ,  Nishimura Yosuke (Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa-Oiwake, Sakyo-ku, Kyoto, 606-8502, Japan) ,  Nishimura Yosuke (Institute for Chemical Research, Kyoto University, Uji, Kyoto 611-0011, Japan) ,  Nishimura Yosuke (Atmosphere and Ocean Research Institute, The University of Tokyo, Chiba, 277-8564, Japan) ,  Yoshida Takashi (Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa-Oiwake, Sakyo-ku, Kyoto, 606-8502, Japan) ,  Ogata Hiroyuki (Institute for Chemical Research, Kyoto University, Uji, Kyoto 611-0011, Japan) ,  Nakano Shin-ichi (Center for Ecological Research, Kyoto University, 2-509-3 Hirano, Otsu, Shiga, 520-2113, Japan)
資料名： Environmental Microbiology  (Environmental Microbiology)
巻： 21  号： 12  ページ： 4740-4754  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2561A  ISSN： 1462-2912  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メタゲノミクスは既知のウイルス球を劇的に拡大したが,淡水ウイルスの多様性と宿主との生態学的相互作用はほとんど理解されていない。ここでは,深い淡水湖(琵琶湖,琵琶湖)から時間的に採取したビリオン(<0.22μm)と細胞(0.22~5.0μm)画分の両方を配列決定することにより,プランクトン性dsDNA原核生物ウイルスのメタゲノム探索を行った。このことは,183の完全な(すなわち,円形)ウイルスゲノムと57の細菌プランクトンメタゲノム集合ゲノムを同時に再構成した。メタゲノム読取被覆の分析は,垂直に層状化した細菌プランクトン群集に類似したウイルス群集の垂直分配を明らかにした。深水層は一般的に層別化の間に安定であったが,時には突然変異し,おそらくは溶原性誘導により変化した。同化硫酸塩還元に関与する遺伝子は,優性ウイルスのそれらを含む20(10.9%)ウイルスゲノムにコードされ,硫黄制限淡水系におけるウイルス増殖を助ける可能性がある。宿主は40(21.9%)のウイルスゲノムに対して予測され,普遍的な淡水細菌プランクトン系統(例えば,Ca.FonsiobacterおよびCa.Nitrosoarchum)を含む10門(またはProteobacteriaのクラス)を網羅していた。公表されたメタゲノム由来のウイルスゲノムとの比較は,地理的に分離された生息場所におけるウイルスの系統地理的連結性を明らかにした。注目すべきことに,それらの宿主に類似して,放線菌ウイルスは淡水系における最も多様で,普遍的で豊富なウイルス群の中にあり,表面水において潜在的に高い溶解活性を有していた。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  溶解 ,  カルシウム ,  突然変異 ,  被覆 ,  ビリオン ,  *淡水湖 ,  *相互作用 ,  放線菌類 ,  硫黄 ,  プランクトン ,  生態学 ,  *ゲノム ,  原核生物 ,  生息場所

分類 (3件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  微生物の生態  (EG03040J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： ゲノム ,  分解 ,  ウイルス ,  細胞 ,  メタゲノム ,  淡水湖 ,  ウイルス-宿主相互作用