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J-GLOBAL ID：201902285025272431   整理番号：19A1239715

肝癌組織におけるCX43の作用標的を,全トランスクリプトームチップによってスクリーニングした。【JST・京大機械翻訳】

Screening the effect targets of CX43 in hepatocellular carcinoma tissues with whole transcriptome sequencing

著者 (7件)： Tan Zhen (266003,青島大学附属医院肝胆yi外科) ,  Guo Weidong (266003,青島大学附属医院肝胆yi外科) ,  Zhang Lu (266003,青島大学附属医院肝胆yi外科) ,  Wu Zehua (266003,青島大学附属医院肝胆yi外科) ,  Zhan Shixiong (266003,青島大学附属医院肝胆yi外科) ,  Liu Shiguo (266003,青島大学附属医院肝胆yi外科) ,  Wang Zusen (266003,青島大学附属医院肝胆yi外科)
資料名： Zhonghua Ganzang Waike Shoushu Xue Dianzi Zazhi  (Zhonghua Ganzang Waike Shoushu Xue Dianzi Zazhi)
巻： 8  号： 2  ページ： 164-168  発行年： 2019年 
JST資料番号： C4007A  ISSN： 2095-3232  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】全トランスクリプトームチップ配列法とバイオインフォマティックスを用いて,ギャップジャンクション蛋白質CX43の下流差次的発現遺伝子をスクリーニングし,その機能を分析する。方法TransIntroTMELを用いて、組換えpCX43プラスミドをヒト肝癌SMMC-7721細胞にトランスフェクションし、CX43過剰発現群を構築し、対照群は空ベクタープラスミドのみにトランスフェクションした。RT-PCR、Westernblotを用いて、トランスフェクション後の細胞のCX43mRNAとタンパク質の発現状況を測定し、両群のCX43mRNAとタンパク発現量の比較にt検定を採用した。全トランスクリプトームチップClariomtmDAssaysを用いて、CX43の下流差異発現遺伝子を選別し、DAVIDとSTRINGデータベースを用いて、差次的発現遺伝子に対して遺伝子機能、シグナル経路とタンパク質相互作用分析を行い、中心ノードタンパク質を決定した。Kaplan-Meier曲線とCox回帰分析を用いて、生存予後における標的タンパク質の価値を評価した。【結果】過剰発現群のCX43mRNAおよび蛋白質発現は,それぞれ363±64および1.36±0.02であり,対照群の1および0.81±0.01より有意に高かった(t=5.67,19.12;P<0.05)。CX43の下流差次的発現遺伝子を選別し、そのうち394個を上方制御し、534個をダウンレギュレートした。STRINGデータベースを用いて9つの中心ノード蛋白質を分析した。Kaplan-Meier曲線とCox回帰分析により、ENO1、RALA、SRC高発現患者の総生存率が悪い(HR=2.29、1.72、1.75;95%CI;1.613.27,1.202.46,1.222.53;P<0.05)。結論:ENO1、RALA、SRCはCX43の下流作用の標的であり、3つの標的タンパク質は生存予後の独立な影響要素であり、標的タンパク質の高発現患者の生存予後は悪い。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ギャップ結合 ,  遺伝子 ,  データベース ,  *肝臓腫瘍 ,  プラスミド ,  回帰分析 ,  ヒト ,  予後 ,  タンパク質 ,  トランスフェクション
準シソーラス用語： 標的蛋白質 ,  t検定 ,  過剰発現 ,  差次的遺伝子発現 ,  バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

タイトルに関連する用語 (5件)： 癌組織 ,  Cx43 ,  標的 ,  トランスクリプトーム ,  スクリーニング