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J-GLOBAL ID：201902285181170701   整理番号：19A2406672

Prunus persica分枝のトランスクリプトームプロファイリングは凍結耐性に潜在的に関与する候補遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome profiling of Prunus persica branches reveals candidate genes potentially involved in freezing tolerance

著者 (6件)： Niu Ruxuan (Horticulture College, Gansu Agriculture University, Anning, Lanzhou, 730070, PR China) ,  Niu Ruxuan (Institute of Fruit and Floriculture Research, Gansu Academy of Agricultural Sciences, Anning, Lanzhou, 730070, PR China) ,  Zhao Xiumei (Institute of Fruit and Floriculture Research, Gansu Academy of Agricultural Sciences, Anning, Lanzhou, 730070, PR China) ,  Wang Chenbing (Institute of Fruit and Floriculture Research, Gansu Academy of Agricultural Sciences, Anning, Lanzhou, 730070, PR China) ,  Wang Falin (Horticulture College, Gansu Agriculture University, Anning, Lanzhou, 730070, PR China) ,  Wang Falin (Institute of Fruit and Floriculture Research, Gansu Academy of Agricultural Sciences, Anning, Lanzhou, 730070, PR China)
資料名： Scientia Horticulturae  (Scientia Horticulturae)
巻： 259  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1940A  ISSN： 0304-4238  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： モモ(Prunus persica var.)は重要な果樹種である。Dingjiaba Liguangtaoはモモの優れた耐寒性品種である。このモモ品種の低温適応機構を理解するために,異なる低温条件下でのこの品種の物理化学的およびトランスクリプトーム的変化を分析した。結果は,寒冷ストレスが可溶性糖,可溶性蛋白質およびプロリンの蓄積を誘発したことを示した。これらの化合物の含有量の増加は,温度が-25°C以下に低下する前に,電解質漏出指数(ELI)とマロンジアルデヒド(MDA)の比較的低く安定なレベル(-20°CでMDAのより高い値にかかわらず)によって示されるように,Dingjiaba Liguangtaoの耐寒性を強化した。一方,抗酸化酵素ペルオキシダーゼ(POD)とスーパーオキシドジスムターゼ(SOD)も,Dingjiaba Liguangtaoにおける寒冷ストレスによって引き起こされた損傷を軽減する役割を果たす。-5°C,-15°C,-25°C,-35°Cで処理した試料のトランスクリプトームを発生させ,特性化した。全部で,690の特異的に発現された遺伝子(DEG)が同定され,693の上方制御された遺伝子と197の下方制御された遺伝子を含んでいた。これらの遺伝子は,38遺伝子オントロジー(GO)用語と,遺伝子とゲノム(KEGG)で定義された経路の64の京都のEncyclopediaに含まれるオーソログ群(COG)の24のクラスターに富んでいた。シグナル伝達,炭水化物及び脂質代謝に関連したDEGは有意に濃縮された。全部で,24科に属する124の転写因子が寒冷応答性であることが分かった。特に,最大遺伝子ファミリーはAP2/ERF遺伝子ファミリーであり,MYBとNACが続いた。まとめると,これらの結果は,この優れた耐寒性モモ種において機能する寒冷適応機構のより良い理解を提供する。本研究で同定されたユニークなDEGは,Prunus persicaにおける耐寒性の低温応答機構と遺伝的増強に関するさらなる研究のための有用な情報を提供する。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 寒冷ストレス ,  低温 ,  耐寒性 ,  転写因子 ,  *トランスクリプトーム ,  *サクラ属 ,  クラスタ ,  品種 ,  キャラクタリゼーション ,  スーパーオキシドジスムターゼ ,  ペルオキシダーゼ ,  *遺伝子 ,  アップレギュレーション ,  アミノ酸 ,  窒素複素環化合物
準シソーラス用語： *候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Prunus persica ,  モモ ,  寒冷ストレス ,  RNA-seq ,  シグナル伝達 ,  代謝 ,  転写因子

分類 (1件)： 果樹  (FC03042G)

物質索引 (1件)： プロリン

タイトルに関連する用語 (4件)： Prunus ,  分枝 ,  凍結耐性 ,  候補遺伝子