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J-GLOBAL ID：201902285509006535   整理番号：19A0878681

長期塩分ストレス中のAegilops tauschiiのトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic analysis of Aegilops tauschii during long-term salinity stress

著者 (7件)： Mansouri Mehdi (Department of Agricultural Biotechnology, Faculty of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran) ,  Naghavi Mohammad Reza (Agronomy and Plant Breeding Department, Agricultural & Natural Resources College, University of Tehran, Karaj, Iran) ,  Alizadeh Hoshang (Agronomy and Plant Breeding Department, Agricultural & Natural Resources College, University of Tehran, Karaj, Iran) ,  Mohammadi-Nejad Ghasem (Department of Agronomy and plant Breeding, College of Agriculture and Center of Excellence for Abiotic Stress in Cereal Crop, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran) ,  Mousavi Seyed Ahmad (Department of Molecular Systems Biology at Cell Science Research Center, Royan Institute for Stem Cell Biology and Technology, ACECR, Tehran, Iran) ,  Salekdeh Ghasem Hosseini (Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Karaj, Iran) ,  Tada Yuichi (School of Bioscience and Biotechnology, Tokyo University of Technology, Tokyo, Japan)
資料名： Functional & Integrative Genomics  (Functional & Integrative Genomics)
巻： 19  号： 1  ページ： 13-28  発行年： 2019年 
JST資料番号： W4378A  ISSN： 1438-7948  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Aegilops tauschiiはパンコムギDゲノムの二倍体前駆体である。それはイランから始まり,非生物的ストレス耐性遺伝子の源である。しかし,Ae.tauschiiにおける塩分耐性の分子事象についてはほとんど知られていない。本研究では,長期塩ストレスに関連する葉の転写変化を調べた。対照および塩処理試料の葉組織から抽出した全RNAをIllina技術を用いて配列決定し,98以上の高品質リードを255,446の単一遺伝子に集合させ,平均長さは1398bp,N50は2269bpであった。単一遺伝子の機能的アノテーションにより,93,742(36.69%)はSwissProtデータベースにおいて少なくとも有意なBLASTヒットを有していたが,174,079(68.14%)はNCBInrデータベースにおける蛋白質と有意な類似性を示した。示差発現分析により,4506の塩ストレス応答性単遺伝子を同定した。差次的に発現した単一遺伝子(DEU)の生物情報学的分析は,イオンホメオスタシス,シグナル伝達過程,炭水化物代謝および翻訳後修飾の確立に関与する多くの生物学的過程および経路を明らかにした。澱粉およびスクロース含量の微細な調節は,Ae.tauschiiにおける塩耐性に関与する重要な特徴である可能性がある。さらに,DEUの82%は,塩耐性に対する既知QTLを含むDサブゲノムにマッピングされ,これらのDEUは,Ae.tauschiiの他の系統において類似の塩ストレス応答を示した。これらの結果は,Ae.tauschiiおよびコムギにおける耐塩性の基礎となる調節過程への基礎的洞察を提供し,それらの塩耐性機構に関与する遺伝子の同定を容易にする。Copyright 2018 Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  澱粉 ,  アノテーション ,  *遺伝子 ,  耐塩性 ,  二倍体 ,  タンパク質 ,  コムギ ,  イラン・イスラム共和国 ,  ホメオスタシス ,  ストレス応答 ,  非生物的ストレス ,  *トランスクリプトーム解析 ,  *Aegilops tauschii ,  *塩分ストレス

著者キーワード (5件)： - ,  - ,  - ,  - ,  -

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： 長期 ,  塩分ストレス ,  Aegilops ,  トランスクリプトーム解析