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J-GLOBAL ID：201902286285401255   整理番号：19A1411766

オミックス関連研究における特徴の固定数選択のための2段階解析【JST・京大機械翻訳】

Two-stage analysis for selecting fixed numbers of features in omics association studies

著者 (5件)： Kawabata Takanori (Clinical Research Promotion Unit, Clinical Research Center, Shizuoka Cancer Center, Shizuoka, Japan) ,  Emoto Ryo (Department of Biostatistics, Nagoya University Graduate School of Medicine, Nagoya, Japan) ,  Nishino Jo (Department of Medical Science Mathematics, Medical Research Institute, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Takahashi Kunihiko (Department of Biostatistics, Nagoya University Graduate School of Medicine, Nagoya, Japan) ,  Matsui Shigeyuki (Department of Biostatistics, Nagoya University Graduate School of Medicine, Nagoya, Japan)
資料名： Statistics in Medicine  (Statistics in Medicine)
巻： 38  号： 16  ページ： 2956-2971  発行年： 2019年 
JST資料番号： A1551A  ISSN： 0277-6715  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ハイスループット技術によるオミクスに基づく関連研究の主要な役割の一つは,関心のある表現型との関連に基づいて,そのような候補の大きなプールから,遺伝的変異体,遺伝子,蛋白質のような関連する分子的特徴をスクリーニングすることである。典型的に,スクリーニングされた特徴は,評価可能な特徴の数が相対的に制限されている,より確立されたまたは従来の分析を用いた検証研究を受けているので,これらの分析により測定可能な固定数の特徴が存在する可能性がある。このような限界は,多重試験による初期スクリーニング解析に続いて,多重度の調整を行うことにより,固定サイズまでの特徴集合を狭くする必要がある。著者らは,初期スクリーニング分析からの特徴集合よりも,検証研究を受けている固定サイズを持つ特徴集合に対する偽発見率(FDR)を制御するための2段階スクリーニング手法を提案した。緩和FDRレベルで第一段階で選択された特徴集合の中で,ほとんどの統計的有意性を有する特徴の一部を最初に選択した。残りの特徴集合に対しては,統計的情報に関しない生物学的考察のみに基づいて特徴を選択し,最終的に選択された特徴集合に対するFDRレベルを固定サイズで評価することを可能にした。提案した二段階スクリーニングアプローチにおいて,電力の改善を検討した。パラメトリックモデルと実際のマイクロアレイデータセットに基づくシミュレーション実験は,標準スクリーニングアプローチと比較して生物学的考察のためのスクリーニングされた特徴の数の実質的な増加を示し,オミクス関連研究におけるより広範で徹底的な生物学的研究を可能にした。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多重化 ,  電力 ,  シミュレーション ,  DNAマイクロアレイ ,  タンパク質 ,  遺伝子 ,  緩和現象 ,  多重度 ,  *スクリーニング ,  表現型
準シソーラス用語： パラメトリックモデル ,  統計的有意性 ,  発見率 ,  ハイスループット ,  *オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 生物学的および統計的意義 ,  偽発見率 ,  特徴スクリーニング ,  オミックス関連研究 ,  二段階法

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： オミックス ,  研究 ,  段階 ,  解析