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J-GLOBAL ID：201902286313050446   整理番号：19A2050289

バイオインフォマティクス解析は腺癌から結腸直腸腺腫を識別する最も顕著な遺伝子候補を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics Analysis Reveals Most Prominent Gene Candidates to Distinguish Colorectal Adenoma from Adenocarcinoma

著者 (5件)： Hauptman Nina (Institute of Pathology, Faculty of Medicine, University of Ljubljana, Ljubljana, Slovenia) ,  Bostjancic Emanuela (Institute of Pathology, Faculty of Medicine, University of Ljubljana, Ljubljana, Slovenia) ,  Zlajpah Margareta (Institute of Pathology, Faculty of Medicine, University of Ljubljana, Ljubljana, Slovenia) ,  Rankovic Branislava (Institute of Pathology, Faculty of Medicine, University of Ljubljana, Ljubljana, Slovenia) ,  Zidar Nina (Institute of Pathology, Faculty of Medicine, University of Ljubljana, Ljubljana, Slovenia)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2018  ページ： Null  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結腸直腸癌(CRC)は世界中の癌による死亡の主要原因の1つである。腸癌スクリーニングプログラムは,早期病変を検出し,CRC患者の予後を改善することを可能にする。しかしながら,それらはまた,初期腺癌を模倣することができる上皮性微小浸潤(偽浸潤)を伴う腺腫のような多くの問題のあるポリープを発生させる。したがって,上皮性乳頭腫(偽浸潤)を伴う腺腫と早期腺癌(真の浸潤)を伴う腺腫を区別することを可能にするバイオマーカーが必要である。前者は腺腫に遺伝的に類似しており,後者は腺癌に類似しており,2つの病変を区別するために潜在的に用いられる候補遺伝子を探索するためのバイオインフォマティクスアプローチを用いた。遺伝子発現Omnibusデータベースから入手可能なデータを使用し,正常粘膜,結腸直腸腺腫,および癌の252試料の遺伝子発現プロファイルを分析した。全部で,122の結腸直腸腺腫,59の結腸直腸癌,および62の正常粘膜サンプルを分析した。腺腫と比較して癌における16の遺伝子を同定した:COL12A1,COL1A2,COL3A1,DCN,PLAU,SPARC,SPON2,SPP1,SULF1,FDS1,KKS1,およびC11orf96。結論として,著者らのin silico分析は,癌と比較して腺腫における異なる発現パターンを有する16の候補遺伝子を明らかにし,これらの2つの病変を区別するために使用される可能性がある。Copyright 2018 Nina Hauptman et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  粘膜 ,  データベース ,  *遺伝子 ,  バイオマーカー ,  ポリープ ,  遺伝子発現 ,  *腺癌 ,  *腺腫 ,  浸潤
準シソーラス用語： in silico ,  候補遺伝子 ,  病巣 ,  結腸直腸癌 ,  *結腸直腸腺腫 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

引用文献 (45件)：

• C. Balch, J. B. Ramapuram, A. K. Tiwari, "The Epigenomics of Embryonic Pathway Signaling in Colorectal Cancer," Frontiers in Pharmacology, vol. 8, 2017.
• E. R. Fearon, B. Vogelstein, "A genetic model for colorectal tumorigenesis," Cell, vol. 61, no. 5, pp. 759-767, 1990.
• M. Malvezzi, G. Carioli, P. Bertuccio, P. Boffetta, F. Levi, C. La Vecchia, E. Negri, "European cancer mortality predictions for the year 2017, with focus on lung cancer," Annals of Oncology, vol. 28, no. 5, pp. 1117-1123, 2017.
• H. Cao, E. Xu, H. Liu, L. Wan, M. Lai, "Epithelial-mesenchymal transition in colorectal cancer metastasis: A system review," Pathology - Research and Practice, vol. 211, no. 8, pp. 557-569, 2015.
• N. A. Shepherd, R. K. L. Griggs, "Bowel cancer screening-generated diagnostic conundrum of the century: Pseudoinvasion in sigmoid colonic polyps," Modern Pathology, vol. 28, pp. S88-S94, 2015.

タイトルに関連する用語 (5件)： バイオインフォマティクス解析 ,  腺癌 ,  結腸直腸腺腫 ,  識別 ,  遺伝子