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J-GLOBAL ID：201902286364116619   整理番号：19A1451931

転写因子PDR-1はアカパンカビにおけるペクチン脱構築と異化の多機能調節因子であり重要な成分である【JST・京大機械翻訳】

The transcription factor PDR-1 is a multi-functional regulator and key component of pectin deconstruction and catabolism in Neurospora crassa

著者 (17件)： Thieme Nils (HFM, TUM School of Life Sciences Weihenstephan, Technical University of Munich, Freising, Germany) ,  Wu Vincent W. (Department of Plant and Microbial Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, USA) ,  Wu Vincent W. (Energy Biosciences Institute, University of California, Berkeley, Berkeley, USA) ,  Dietschmann Axel (HFM, TUM School of Life Sciences Weihenstephan, Technical University of Munich, Freising, Germany) ,  Dietschmann Axel (Department of Infection Biology, Institute for Clinical Microbiology, Immunology and Hygiene, Universitaetsklinikum Erlangen and Friedrich-Alexander Universitaet, Erlangen-Nuremberg, Germany) ,  Salamov Asaf A. (US Department of Energy Joint Genome Institute (JGI), Walnut Creek, USA) ,  Wang Mei (US Department of Energy Joint Genome Institute (JGI), Walnut Creek, USA) ,  Johnson Jenifer (US Department of Energy Joint Genome Institute (JGI), Walnut Creek, USA) ,  Singan Vasanth R. (US Department of Energy Joint Genome Institute (JGI), Walnut Creek, USA) ,  Grigoriev Igor V. (Department of Plant and Microbial Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, USA) ,  Grigoriev Igor V. (US Department of Energy Joint Genome Institute (JGI), Walnut Creek, USA) ,  Glass N. Louise (Department of Plant and Microbial Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, USA) ,  Glass N. Louise (Energy Biosciences Institute, University of California, Berkeley, Berkeley, USA) ,  Glass N. Louise (Environmental Genomics and System Biology, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, USA) ,  Somerville Chris R. (Department of Plant and Microbial Biology, University of California, Berkeley, Berkeley, USA) ,  Somerville Chris R. (Energy Biosciences Institute, University of California, Berkeley, Berkeley, USA) ,  Benz J. Philipp (HFM, TUM School of Life Sciences Weihenstephan, Technical University of Munich, Freising, Germany)
資料名： Biotechnology for Biofuels (Web)  (Biotechnology for Biofuels (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 149  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7022A  ISSN： 1754-6834  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ペクチンは,多くの果物および野菜廃棄物における豊富な成分であり,したがって,バイオリファイナリーのための優れた資源であることができるが,現在,利用されていない。菌類のペクチナーゼは,食品加工のような工業的目的に対して既に重要な役割を果たしている。しかし,ペクチナーゼ遺伝子発現の調節はまだ十分に理解されていない。バイオリファイナリーとバイオ燃料生産のための植物バイオマスの最適利用のために,根底にある規制機構の詳細な分析が必要である。本研究では,ペクチナーゼ誘導において主要な役割を果たす転写因子をスクリーニングするために,糸状子嚢菌種Neurospora crassaの遺伝資源を適用した。【結果】ペクチン分解調節因子-1(PDR-1)を,N.crassaにおける転写因子突然変異体スクリーニングを通して同定した。Δpdr-1突然変異体はペクチン上に重度の成長欠陥を示し,全ての試験したペクチン関連ポリ-及び単糖類を示した。WTおよびΔpdr-1変異体の生化学的および転写解析は,PDR-1仲介遺伝子誘導がL-ラムノースの存在に依存する一方,ホモガラクツロナン骨格の分解にも強く影響することを明らかにした。エンドポリガラクツロナーゼh28-1の発現はΔpdr-1変異体で大きく減少したが,全てのペクチン酸リアーゼ遺伝子の発現レベルは増加した。さらに,pdr-1過剰発現株はペクチナーゼ生産を実質的に増加させた。PDR-1レギュロンのプロモーター分析は,推定PDR-1 DNA結合モチーフの精密化を可能にした。【結論】PDR-1は糸状子嚢菌において高度に保存され,多くの病原性および工業的に重要な真菌類に存在する。著者らのデータは,N.crassaにおけるPDR-1の機能がAspergillus niger(rhAR)およびBotrytis cinerea(GAAR)における2つの最近記述された転写因子の特徴を組み合わせていることを示す。本研究で示された結果は,ペクチン分解が糸状真菌でどのように調整されているか,そしてそれが最適化ペクチナーゼ生産のためにどのように操作できるかについてのより広い理解に貢献する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ペクチナーゼ ,  遺伝子発現 ,  *異化 ,  DNA【核酸】 ,  *ペクチン ,  Aspergillus ,  野菜 ,  Botrytis ,  *転写因子 ,  生化学 ,  *アカパンカビ ,  スクリーニング ,  最適化
準シソーラス用語： 過剰発現 ,  バイオリファイナリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： ペクチン分解 ,  L-ラムノース異化 ,  D-ガラクツロン酸異化 ,  遺伝子調節 ,  Zn2Cys6転写因子 ,  アカパンカビ ,  バイオ製油所

分類 (2件)： 微生物酵素の生産  (FK03030L) ,  生物燃料及び廃棄物燃料  (LB02020Y)

引用文献 (83件)：

• J Biotechnol; Systems biological approaches towards understanding cellulase production by Trichoderma reesei; CP Kubicek; 163; 2013; 133-142; 10.1016/j.jbiotec.2012.05.020; CR1;
• Biotechnol Lett; Biotechnological potential of pectinolytic complexes of fungi; A Lara-Márquez, MG Zavala-Páramo, E López-Romero, HC Camacho, A Lara-Marquez, MG Zavala-Paramo; 33; 2011; 859-868; 10.1007/s10529-011-0520-0; CR2;
• Prog Biotechnol; An hypothesis: the same six polysaccharides are components of the primary cell walls of all higher plants; P Albersheim, AG Darvill, MA O’Neill, HA Schols, AGJ Voragen; 14; 1996; 47-55; 10.1016/S0921-0423(96)80245-0; CR3;
• J Exp Bot; We be jammin’: an update on pectin biosynthesis, trafficking and dynamics; CT Anderson; 67; 2016; 495-502; 10.1093/jxb/erv501; CR4;
• Front Plant Sci; How to let go: pectin and plant cell adhesion; FB Daher, SA Braybrook; 6; 2015; 523; 10.3389/fpls.2015.00523; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： 転写因子 ,  アカパンカビ ,  ペクチン ,  構築 ,  異化 ,  多機能 ,  調節因子