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J-GLOBAL ID：201902286699238668   整理番号：19A0079719

嚢胞性線維症患者におけるCFTR遺伝子座を包含する460kbの調節変異体のスクリーニング【JST・京大機械翻訳】

Screening for Regulatory Variants in 460 kb Encompassing the CFTR Locus in Cystic Fibrosis Patients

著者 (14件)： Kerschner Jenny L. (Department of Genetics and Genome Sciences, Case Western Reserve University, Cleveland, Ohio) ,  Ghosh Sujana (Human Molecular Genetics Program, Lurie Children’s Research Center, Chicago, Illinois) ,  Ghosh Sujana (Department of Pediatrics, Northwestern University Feinberg School of Medicine, Chicago, Illinois) ,  Paranjapye Alekh (Department of Genetics and Genome Sciences, Case Western Reserve University, Cleveland, Ohio) ,  Cosme Wilmel R. (Department of Genetics and Genome Sciences, Case Western Reserve University, Cleveland, Ohio) ,  Audrezet Marie-Pierre (INSERM U1078, Brest, France) ,  Nakakuki Miyuki (Department of Human Nutrition, Nagoya University Graduate School of Medicine, Nagoya, Japan) ,  Ishiguro Hiroshi (Department of Human Nutrition, Nagoya University Graduate School of Medicine, Nagoya, Japan) ,  Ferec Claude (INSERM U1078, Brest, France) ,  Rommens Johanna (Program in Genetics and Genome Biology, Research Institute, The Hospital for Sick Children, Toronto, Ontario, Canada) ,  Rommens Johanna (Department of Molecular Genetics, University of Toronto, Toronto, Ontario, Canada) ,  Harris Ann (Department of Genetics and Genome Sciences, Case Western Reserve University, Cleveland, Ohio) ,  Harris Ann (Human Molecular Genetics Program, Lurie Children’s Research Center, Chicago, Illinois) ,  Harris Ann (Department of Pediatrics, Northwestern University Feinberg School of Medicine, Chicago, Illinois)
資料名： Journal of Molecular Diagnostics  (Journal of Molecular Diagnostics)
巻： 21  号： 1  ページ： 70-80  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3144A  ISSN： 1525-1578  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 嚢胞性線維症膜貫通コンダクタンス調節因子(CFTR)病原性対立遺伝子の最大5%が同定されていないと推定される。これらの誤差のいくつかは,遺伝子座の非コード領域にあり,遺伝子発現に影響を及ぼす可能性がある。CFTR遺伝子座における調節要素変異体を同定するために,遺伝子を網羅する460kbのSureSelect標的化濃縮を,非明確な臨床診断を有する80CF患者からの深い配列ゲノムDNAに最適化したが,CFTRコード領域病原性変異体は1つまたは全くなかった。バイオインフォマティクスツールを用いて,配列変異体を同定し,それらの影響を予測し,それを一時的レポーター遺伝子ルシフェラーゼアッセイで分析した。CFTRプロモーターにおける5つの変異体及び遺伝子の腸エンハンサーにおける4つの変異体の影響を関連細胞株においてアッセイした。配列データの初期分析により,以前に知られたCF原因変異体を明らかにし,SureSelect設計のロバスト性を検証し,160のCF対立遺伝子の85が定義されていないことを示した。全1737の変異体のうち,拡張された460kb CFTR遺伝子座を横切って明らかになり,51の地図は既知のCFTR cis調節要素に対して,これらの多くは転写因子占有を変化させると予測された。4つのプロモーター変異体と腸エンハンサーの全てはレポーター遺伝子活性を有意に抑制した。これらのデータはCFTR調節要素が遺伝的スクリーニングプロトコルと機能的アッセイの両方に対してさらなる研究を保証する新規CF疾患原因変異体を持つ可能性があることを示唆する。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  レポーター遺伝子 ,  転写因子 ,  対立遺伝子 ,  コンダクタンス ,  プロモーター領域 ,  *嚢胞性線維症 ,  *スクリーニング ,  最適化 ,  遺伝子発現 ,  ターゲティング
準シソーラス用語： ルシフェラーゼアッセイ ,  バイオインフォマティクス ,  非翻訳領域 ,  *嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 先天性疾患・奇形一般  (GD03010V) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： 嚢胞性線維症 ,  患者 ,  CFTR ,  遺伝子座 ,  調節 ,  変異体 ,  スクリーニング