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J-GLOBAL ID：201902289522595782   整理番号：19A1884187

Bcl-xLのBH3のみ蛋白質結合界面の固有構造不均一性の増強サンプリング【JST・京大機械翻訳】

Enhanced Sampling of Intrinsic Structural Heterogeneity of the BH3-Only Protein Binding Interface of Bcl-xL

著者 (4件)： Liu Xiaorong (Department of Chemistry, University of Massachusetts Amherst) ,  Jia Zhiguang (Department of Chemistry, University of Massachusetts Amherst) ,  Chen Jianhan (Department of Chemistry, University of Massachusetts Amherst) ,  Chen Jianhan (Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Massachusetts Amherst)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 121  号： 39  ページ： 9160-9168  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 抗アポトーシスBcl-xLはプログラム細胞死の調節に中心的役割を果たす。Bcl-xLの部分的非折畳みは,プロアポトーシスBH3のみの蛋白質PUMAに特異的に結合する界面で観察され,それは腫瘍抑制因子p53とBcl-xLの相互作用を破壊し,アポトーシスを促進する。既存のBcl-xL構造及び原子論的分子動力学(MD)シミュレーションの以前の解析は,結合によるその立体配座転移を促進するために,Bcl-xLのBH3のみの蛋白質結合界面に本質的な固有構造不均一性が存在することを示唆した。本研究では,増強サンプリングを適用して,明示的溶媒中の非結合Bcl-xLの界面立体配座をさらに特性化した。16μsの全蓄積時間をもつ溶質テンパリング(REST)シミュレーションによる広範なレプリカ交換は,Bcl-xLの界面領域に対するより広い立体配座空間をカバーすることができた。得られた構造集合は,既存のNMRデータと高度に一致する局所的で長距離の構造的特徴を有する非常に良い収束であった。これらのシミュレーションにより,Bcl-xLのBH3のみの蛋白質結合界面は本質的に無秩序であり,多くの迅速な相互変換立体配座を有することを示した。興味深いことに,以前に観測されたすべての配座異性体は,非結合構造集合体で良く表現されている。このような本質的な構造的不均一性と柔軟性は,PUMA結合により誘導される部分的変性を受けるBcl-xLにとって重要である可能性があり,Bcl-xLが細胞シグナル伝達と調節における種々のリガンドの結合に敏感に応答することを可能にする強固な基礎を提供する可能性がある。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ロバスト性 ,  立体配座 ,  NMR【磁気共鳴】 ,  柔軟性 ,  配座転移 ,  キャラクタリゼーション ,  分子動力学 ,  シミュレーション ,  相互作用 ,  デコンボリューション ,  細胞情報伝達 ,  *不均一性 ,  アポトーシス ,  *界面
準シソーラス用語： *Bcl-XL , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  ミセル  (CB11020N)

タイトルに関連する用語 (8件)： Bcl-XL ,  BH3 ,  蛋白質 ,  結合界面 ,  固有 ,  不均一性 ,  増強 ,  サンプリング