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J-GLOBAL ID：201902289776943434   整理番号：19A0178260

人工メタボロームにおける基質チャネリング:実験的ペプチドブリッジに対する分子動力学青写真【JST・京大機械翻訳】

Substrate Channeling in an Artificial Metabolon: A Molecular Dynamics Blueprint for an Experimental Peptide Bridge

著者 (9件)： Liu Yuanchao (Department of Chemical Engineering and Materials Science, Michigan State University, Michigan, United States) ,  Hickey David P. (Department of Chemistry, University of Utah, Utah, United States) ,  Guo Jing-Yao (Department of Chemistry, University of Utah, Utah, United States) ,  Earl Erica (Department of Chemical Engineering and Materials Science, Michigan State University, Michigan, United States) ,  Abdellaoui Sofiene (Department of Chemistry, University of Utah, Utah, United States) ,  Milton Ross D. (Department of Chemistry, University of Utah, Utah, United States) ,  Sigman Matthew S. (Department of Chemistry, University of Utah, Utah, United States) ,  Minteer Shelley D. (Department of Chemistry, University of Utah, Utah, United States) ,  Calabrese Barton Scott (Department of Chemical Engineering and Materials Science, Michigan State University, Michigan, United States)
資料名： ACS Catalysis  (ACS Catalysis)
巻： 7  号： 4  ページ： 2486-2493  発行年： 2017年 
JST資料番号： W5035A  ISSN： 2155-5435  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 天然酵素カスケードは,基質チャネリングとして知られているプロセスにおける触媒活性部位間の荷電反応中間体の拡散を制御するための効果的な技術として静電誘導を利用する。しかし,チャネリング機構の限られた理解は,人工触媒カスケードにおけるこの技術の応用を弱めている。本研究では,分子動力学シミュレーションを用いて,理論的カチオン性α-ヘリックスペプチドブリッジ上でのアニオン中間体(例えば,シュウ酸およびグルコース-6-りん酸)の輸送を記述し,静電チャネリングの分子レベル設計のためのルールを同定した。これらのシミュレーションにより,アニオン中間体がペプチド架橋上の隣接カチオン残基に沿った離散的水素結合相互作用を受ける表面拡散機構を解明することができた。基礎的ブループリントとしてMDシミュレーションを用いて,グルコース-6-りん酸デヒドロゲナーゼとヘキソキナーゼ間のカチオン架橋としてポリ-(リジン)ペプチド鎖を用いて酵素複合体を合成した。ストップトフローラグ時間実験は,人工的に結合した酵素複合体の静電基質チャネリングを促進する能力を示し,一方,類似の中性ポリ(グリシン)架橋複合体を人工基質チャネリングからの近接効果を分離するための制御として用いた。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 水素結合 ,  カチオン ,  *チャネリング ,  電荷 ,  *ペプチド ,  リン酸 ,  複合酵素系 ,  *基質 ,  アニオン ,  計算機シミュレーション ,  触媒 ,  複合体 ,  中間体 ,  *分子動力学 ,  脂肪族カルボン酸 ,  ジカルボン酸
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 静電拡散 ,  酵素カスケード ,  表面拡散 ,  グルコース-6-リン酸デヒドロゲナーゼ ,  ヘキソキナーゼ ,  ポリ(リジン)

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： シュウ酸

タイトルに関連する用語 (9件)： 人工 ,  メタボローム ,  基質 ,  チャネリング ,  実験 ,  ペプチド ,  ブリッジ ,  分子動力学 ,  青写真