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J-GLOBAL ID：201902289906989200   整理番号：19A0886856

CanproVar2.0:ヒト癌プロテオーム変異の最新データベース【JST・京大機械翻訳】

CanProVar 2.0: An Updated Database of Human Cancer Proteome Variation

著者 (14件)： Zhang Menghuan (Department of Bioinformatics & Biostatistics, School of Life Science and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, China) ,  Zhang Menghuan (Shanghai Center for Bioinformation Technology, Shanghai Academy of Science and Technology, China) ,  Wang Bo (Department of Bioinformatics & Biostatistics, School of Life Science and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, China) ,  Xu Jia (Department of Bioinformatics & Biostatistics, School of Life Science and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, China) ,  Wang Xiaojing (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine) ,  Wang Xiaojing (Lester & Sue Smith Breast Center, Baylor College of Medicine) ,  Xie Lu (Shanghai Center for Bioinformation Technology, Shanghai Academy of Science and Technology, China) ,  Zhang Bing (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine) ,  Zhang Bing (Lester & Sue Smith Breast Center, Baylor College of Medicine) ,  Li Yixue (Department of Bioinformatics & Biostatistics, School of Life Science and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, China) ,  Li Yixue (Shanghai Center for Bioinformation Technology, Shanghai Academy of Science and Technology, China) ,  Li Yixue (Key Lab of Systems Biology, Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, China) ,  Li Jing (Department of Bioinformatics & Biostatistics, School of Life Science and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, China) ,  Li Jing (Shanghai Center for Bioinformation Technology, Shanghai Academy of Science and Technology, China)
資料名： Journal of Proteome Research  (Journal of Proteome Research)
巻： 16  号： 2  ページ： 421-432  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1632A  ISSN： 1535-3893  CODEN： JPROBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腫瘍形成と腫瘍進行に関与する突然変異の同定とアノテーションは,癌生物学と臨床応用の両方にとって重要である。以前に,ヒト癌における単一アミノ酸変化を保存し,質問するためのヒト癌プロテオーム変異データベース,公共資源CanProVarを開発した。CanProVarの発表以来,広範な癌ゲノミクス努力は,様々なタイプのヒト癌の膨大なゲノム複雑性を明らかにした。したがって,蛋白質レベルにおけるゲノム変化の包括的アノテーションのための圧倒的な必要性があり,そのような知識を容易にアクセスできるようにした。ここでは,癌関連変異と非癌特異的変異の量が,以前のバージョンと比較して約10倍増加したCanProVarの有意に拡大されたバージョンであるCanProVar 2.0を記述する。変異の解釈を容易にするために,3D蛋白質相互作用に及ぼす癌関連変異の潜在的影響に関するデータベース機能データ,及び癌と正常試料間の変異体を有する蛋白質の差次的発現について追加した。Webインタフェースは,遺伝子または蛋白質ID,癌タイプ,染色体位置または経路に基づく柔軟な質問を可能にする。プロテオミクスデータベース検索に直接使用できる変動を含む統合蛋白質配列データベースをダウンロードできる。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *変異 ,  *プロテオーム ,  プロテオミクス ,  タンパク質 ,  突然変異 ,  腫瘤形成 ,  *データベース ,  遺伝子 ,  *ヒト ,  アミノ酸 ,  アノテーション
準シソーラス用語： 差次的遺伝子発現 ,  複雑性 ,  ゲノミクス ,  腫瘍進行 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： プロテオーム ,  変動 ,  データベース ,  癌

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： ヒト ,  癌 ,  プロテオーム ,  変異 ,  データベース