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J-GLOBAL ID：201902290843296058   整理番号：19A0183299

DNA上の標的の蛋白質探索における立体配座転移領域の最適長【JST・京大機械翻訳】

Optimal Length of Conformational Transition Region in Protein Search for Targets on DNA

著者 (3件)： Kochugaeva Maria P. (Department of Chemistry and Center for Theoretical Biological Physics, Rice University, Texas, United States) ,  Berezhkovskii Alexander M. (Maryland, United States) ,  Kolomeisky Anatoly B. (Department of Chemistry and Center for Theoretical Biological Physics, Rice University, Texas, United States)
資料名： Journal of Physical Chemistry Letters  (Journal of Physical Chemistry Letters)
巻： 8  号： 17  ページ： 4049-4054  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3687A  ISSN： 1948-7185  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの基本的生物学的過程の出発点は,DNA上の特異的部位を見出し認識する蛋白質分子と関連している。しかしながら,DNA上の標的に対する蛋白質探索に関する多数の実験的及び理論的研究にもかかわらず,基礎となる機構の多くの分子的側面はまだ十分に理解されていない。実験は,DNAに結合した蛋白質が遅い認識と速い探索立体配座の間を切り替えることができることを示した。しかしながら,理論的観点から,このような立体配座転移は,利用可能な実験的観察とは対照的に,DNA上の特異的部位に対する蛋白質探索を遅くするはずである。加えて,実験は,標的部位近くのヌクレオチド組成がより対称的に均一で,これらの位置で蛋白質とDNA間のより強い効果的相互作用をもたらすことを示した。しかし,理論的に示されているように,これはまた,観察されない探索をより効率的でなくする必要がある。立体配座転移が蛋白質とDNA間のより強い相互作用が観察される標的周辺のセグメント内でのみ起こることを示唆することにより,これらの問題の可能な解決法を提案した。連続体と離散状態確率計算に基づく2つの理論的方法を開発し,このシステムにおける蛋白質探索過程の包括的動的記述を得ることを可能にした。最短平均探索時間を持つ配座転移領域の最適長さの存在を予測した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *タンパク質 ,  対称性 ,  *DNA【核酸】 ,  相互作用 ,  *配座転移 ,  *立体配座 ,  強い相互作用 ,  連続体 ,  ヌクレオチド
準シソーラス用語： 生物学的過程 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (5件)： DNA ,  標的 ,  蛋白質 ,  探索 ,  立体配座転移