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J-GLOBAL ID：201902291173367776   整理番号：19A1802974

触媒RNAにおける二価金属イオンと核酸塩基との内圏配位【JST・京大機械翻訳】

Inner-Sphere Coordination of Divalent Metal Ion with Nucleobase in Catalytic RNA

著者 (4件)： Liu Xin (Departments of Chemistry, University of Michigan) ,  Chen Yu (Departments of Chemistry, University of Michigan) ,  Fierke Carol A. (Departments of Chemistry, University of Michigan) ,  Fierke Carol A. (Biological Chemistry, University of Michigan)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 139  号： 48  ページ： 17457-17463  発行年： 2017年 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 金属イオンとRNA部分,特に核酸塩基の機能を同定することは,RNA触媒において重要である。ここでは,リボヌクレアーゼP(RNアーゼP)における保存核酸塩基の機能をプローブするために,単一原子と脱塩基置換を組み合わせた。細菌RNアーゼPの構造的及び生物物理学的研究は,RNAサブユニット(P RNA)のヘリックスP4における保存ウリジン及びグアノシンの核酸塩基による金属イオンの直接配位を提案する。金属イオン相互作用の機能を生化学的に調べるために,4-チオウリジン,4-デオキシウリジン,及び脱塩基修飾及び2-アミノプリン,N7-デアザグアニジン,及び6-チオグアノシンを用いて,環状に保存されたBacillus subtilis P RNAのP4ヘリックスにおける普遍的に保存されたバルジウリジン(U51)を置換した。U51の官能基修飾は,単一ターンオーバ開裂速度定数により測定されたように,RNアーゼP触媒ホスホジエステル結合開裂を16~23倍減少させた。4-チオウリジンRNアーゼPの活性はCd-(II)またはMn-(II)イオンの添加により部分的に救済された。これは初めて金属救助実験が核酸塩基との内圏二価金属イオン配位の証拠を提供する。G379の修飾はRNアーゼPの開裂活性を低下させ,G379上のO6の金属イオンへの外圏配位を示唆した。これらのデータは,P RNAのP4ヘリックスと金属イオンとの触媒的に重要な相互作用に対する生化学的証拠を提供し,バルクウリジンが少なくとも1つの触媒金属イオンを内部球相互作用により配位することを示した。単一原子と脱塩基性ヌクレオチド置換の組合せは,大RNAにおける保存核酸塩基の機能をプローブする強力な戦略を提供する。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヌクレオチド ,  *金属イオン ,  *触媒 ,  *イオン ,  *RNA【核酸】 ,  サブユニット ,  開裂反応 ,  相互作用 ,  プローブ ,  *核酸塩基 ,  枯草菌 ,  プリンヌクレオシド ,  リボヌクレオシド ,  ピリミジンヌクレオシド
準シソーラス用語： 官能基 ,  単一原子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  ヌクレオシド,ヌクレオチド  (CF10060K)

物質索引 (2件)： グアノシン ,  ウリジン

タイトルに関連する用語 (3件)： 触媒RNA ,  二価金属イオン ,  核酸塩基