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J-GLOBAL ID：201902291861578218   整理番号：19A1287191

MinK(Neovison Vison)からのDQA遺伝子の分子クローニングとバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of DQA Gene from Mink (Neovison vison)

著者 (7件)： Fan Zhaobin (College of Pharmacy, Heze University, Heze 274015, China) ,  Zhang Houfeng (College of Pharmacy, Heze University, Heze 274015, China) ,  Rong Min (Institute of Specialty Animal and Plant Sciences of CAAS, Chinese Academy of Agriculture Science, Changchun 130112, China) ,  Meng Dongmei (College of Pharmacy, Heze University, Heze 274015, China) ,  Yu Zhenxing (College of Pharmacy, Heze University, Heze 274015, China) ,  Jiang Lili (College of Pharmacy, Heze University, Heze 274015, China) ,  Jiang Peihong (College of Pharmacy, Heze University, Heze 274015, China)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 20  号： 5  ページ： 1037  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究で著者らは,ミンク(Neovison vison)からの主要組織適合性複合体(MHC)-DQA遺伝子の構造的および機能的特性を初めてクローン化し,配列決定し,探索した。DQA遺伝子の完全長配列は1147bp長で,768bpのコード領域を含み,255アミノ酸残基をコードすると予測された。異なる動物種からのDQAと他のMHC-DQA分子との比較は,ミンクDQA遺伝子のヌクレオチドとコード化アミノ酸配列がフェレット(Mustela pulourius furo)と高い類似性を示すことを示した。系統発生分析により,ミンク(Neovison vison)DQAがフェレット(Mustela pulourius furo)のそれとグループ化されることを明らかにした。クローン化配列はアミノ酸2324に位置するシグナルペプチド切断部位を持つ23アミノ酸N末端シグナル配列を含み,3つのAsn-Xaa-Ser/Thr配列を持っていた。3つのシステイン残基も同定された(Cys-85,Cys-121およびCys-138)。218~240アミノ酸は膜貫通ドメインであると予測された。二次構造の予測は,NeovisonビオンDQA蛋白質において3つのヘリックスと14のシートを明らかにしたが,ランダムコイルは主要なパターンであった。本研究において,NeovisonビオンDQA遺伝子の全CDS配列を成功裏にクローン化し,それは分子の基礎となる機能及び抗ウイルス分子機構の探索に有用であった。本研究の知見は,ミンクの耐病性と育種の基礎を築いた。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 二次構造 ,  アミノ酸残基 ,  育種 ,  ヌクレオチド ,  フェレット ,  アミノ酸配列 ,  シグナルペプチド ,  クローン ,  ミンク ,  *遺伝子クローニング ,  耐病性 ,  タンパク質 ,  *遺伝子 ,  複合体
準シソーラス用語： *Neovison , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 主要組織適合性複合体 ,  MINK ,  DQA遺伝子 ,  Neovison Vison

分類 (4件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (35件)：

• Steidl, C.; Shah, S.P.; Woolcock, B.W.; Rui, L.; Kawahara, M.; Farinha, P.; Johnson, N.A.; Zhao, Y.; Telenius, A.; Neriah, S.B.; et al. MHC class II transactivator CIITA is a recurrent gene fusion partner in lymphoid cancers. Nature 2011, 471, 377-381.
• Ziegler, A.; Dohr, G.; Uchanska, Z.B. Possible Roles for Products of Polymorphic MHC and Linked Olfactory Receptor Genes during Selection Processes in Reproduction. Am. J. Reprod. Immunol. 2015, 48, 34-42.
• Juul-Madsen, H.R.; Dalgaard, T.S.; Afanassieff, M. Molecular characterization of major and minor MHC class I and II genes in B21-like haplotypes in chickens. Anim. Genet. 2015, 31, 252-261.
• Gao, W.J.; Zhu, Z.Y. Polymorphic Analysis of MHC-DQA and MHC-DRB Gene Exon 2 in Asiatic Black Bear (Ursus thibetanus). China Anim. Husb. Vet. Med. 2014, 41, 157-164.
• Mckinney, D.M.; Southwood, S.; Hinz, D.; Oseroff, C.; Arlehamn, C.S.; Schulten, V.; Taplitz, R.; Broide, D.; Hanekom, W.A.; Scriba, T.J.; et al. A strategy to determine HLA class II restriction broadly covering the DR, DP and DQ allelic variants most commonly expressed in the general population. Immunogenetics 2013, 65, 357-370.

タイトルに関連する用語 (3件)： 遺伝子 ,  分子クローニング ,  バイオインフォマティクス解析