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J-GLOBAL ID：201902291891229904   整理番号：19A0182166

レプリカ交換分子動力学シミュレーションによるAβ42二量体の初期構造モデル【JST・京大機械翻訳】

Initial Structural Models of the Aβ42 Dimer from Replica Exchange Molecular Dynamics Simulations

著者 (7件)： Blinov Nikolay (Department of Mechanical Engineering, University of Alberta, Alberta, Canada) ,  Blinov Nikolay (National Institute for Nanotechnology, National Research Council of Canada, Alberta, Canada) ,  Khorvash Massih (Department of Medicine, University of British Columbia, British Columbia, Canada) ,  Wishart David S. (Departments of Computing Science and Biological Sciences, University of Alberta, Alberta, Canada) ,  Cashman Neil R. (Department of Medicine, University of British Columbia, British Columbia, Canada) ,  Kovalenko Andriy (National Institute for Nanotechnology, National Research Council of Canada, Alberta, Canada) ,  Kovalenko Andriy (Department of Mechanical Engineering, University of Alberta, Alberta, Canada)
資料名： ACS Omega  (ACS Omega)
巻： 2  号： 11  ページ： 7621-7636  発行年： 2017年 
JST資料番号： W5044A  ISSN： 2470-1343  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アルツハイマー病における毒性物質として現在考えられている小アミロイド(A)-βオリゴマーの分子構造の実験的特性化は,それらの過渡的性質と凝集体への傾向のために困難な仕事である。このような構造情報は,診断の開発と疾患の有効な治療に役立つので,重要である。本研究において,分子シミュレーションと蛋白質-蛋白質ドッキングを用いて,Aβ単量体の構造とAβ42二量体における単量体間界面の性質の間の可能な結合を調べた。単量体の立体配座の構造的に多様な集合体を,マイクロ秒時間スケール陰的溶媒レプリカ交換分子動力学シミュレーションにおいてサンプリングした。疎水性残基の異なる溶媒曝露と二次構造含有量を有する代表的構造を,二量体の構造モデルを構築するために選択した。これらのモデルの解析により,Asp23とLys28残基間の分子内塩橋(SB)の形成は二量体化による単量体の中心疎水性クラスタ(CHCs)間の疎水性界面の構築を防止できることを明らかにした。Aβ42二量体のこの構造的特徴は,特に,形成されたSBを有する単量体中のCHCドメインとC末端残基の間の疎水性接触を形成する低い傾向に対して,Asp23-Lys28SBを有する単量体中の疎水性残基の充填の違いに関連していた。これらの知見は,神経毒性オリゴマーまたは不活性フィブリル構造に導くAβ単量体の凝集経路間の差異を理解するために重要な意味を持つ可能性がある。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： Alzheimer病 ,  凝集 ,  界面 ,  タンパク質 ,  *二量体 ,  *計算機シミュレーション ,  単量体 ,  二次構造 ,  立体配座 ,  キャラクタリゼーション ,  *モデル ,  疎水性
準シソーラス用語： 残基 ,  *アミロイドβ42 ,  *分子動力学シミュレーション ,  *レプリカ交換 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： レプリカ交換 ,  分子動力学シミュレーション ,  Aβ42 ,  二量体 ,  初期 ,  構造モデル